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Enregistrement W3000910295 · doi:10.3389/fevo.2019.00501

Consequences of Lack of Parameterization Invariance of Non-informative Bayesian Analysis for Wildlife Management: Survival of San Joaquin Kit Fox and Declines in Amphibian Populations

2020· article· en· W3000910295 sur OpenAlexaff
Subhash R. Lele

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Ecology and Evolution · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrior probabilityBayesian probabilityEconometricsBayesian inferenceArgument (complex analysis)Context (archaeology)InferenceFrequentist inferenceSample (material)Sample size determinationComputer scienceStatisticsMathematicsArtificial intelligenceGeographyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Computational convenience has led to widespread use of Bayesian inference with vague or flat priors to analyze statistical models in ecology. Vague priors are claimed to be objective and to `let the data speak'. However, statisticians have long disputed these claims and have criticized the use of vague priors from philosophical to computational to pragmatic reasons. One of the major criticisms is that the inferences based on non-informative priors are generally dependent on the parameterization of the models. Ecologists, unfortunately, often dismiss such criticisms as having no practical implications. One argument is that for large sample sizes, the priors do not matter. The problem with this argument is that, in practice, one does not know whether or not the observed sample size is sufficiently large for the effect of the prior to vanish. It intricately depends on the complexity of the model and the strength of the prior. We study the consequences of parameterization dependence of the non-informative Bayesian analysis in the context of population viability analysis and occupancy models and at the commonly obtained sample sizes. We show that they can have significant impact on the analysis, in particular on prediction, and can lead to strikingly different managerial decisions. In general terms, the consequences are: (1) All subjective Bayesian inferences can be masqueraded as objective (flat prior) Bayesian inferences, (2) Induced priors on functions of parameters are not flat, thus leading to cryptic biases in scientific inferences, (3) Unrealistic independent priors for multiparameter models lead to unrealistic priors on induced parameters, (4) Bayesian prediction intervals may not have correct coverage, thus leading to errors in decision making, (5) Reparameterization to facilitate MCMC convergence may influence scientific inference. Given the wide spread applicability of the hierarchical models and uncritical use of non-informative Bayesian analysis in ecology, researchers should be cautious about using vague priors as a default choice in practical situations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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