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Enregistrement W3001418617 · doi:10.1038/s41598-020-57975-y

Unorthodox features in two venerid bivalves with doubly uniparental inheritance of mitochondria

2020· article· en· W3001418617 sur OpenAlexafffund
Charlotte Capt, Karim Bouvet, Davide Guerra, Brent M. Robicheau, Donald T. Stewart, Eric Pante, Sophie Breton

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Invertebrate Ecology and Behavior
Établissements canadiensAcadia UniversityDalhousie UniversityUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaLa Rochelle UniversitéAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésMitochondrial DNABiologyGeneticsGenomeGeneInheritance (genetic algorithm)Evolutionary biologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In animals, strictly maternal inheritance (SMI) of mitochondria is the rule, but one exception (doubly uniparental inheritance or DUI), marked by the transmission of sex-specific mitogenomes, has been reported in bivalves. Associated with DUI is a frequent modification of the mitochondrial cox2 gene, as well as additional sex-specific mitochondrial genes not involved in oxidative phosphorylation. With the exception of freshwater mussels (for 3 families of the order Unionida), these DUI-associated features have only been shown in few species [within Mytilidae (order Mytilida) and Veneridae (order Venerida)] because of the few complete sex-specific mitogenomes published for these orders. Here, we present the complete sex-specific mtDNAs of two recently-discovered DUI species in two families of the order Venerida, Scrobicularia plana (Semelidae) and Limecola balthica (Tellinidae). These species display the largest differences in genome size between sex-specific mitotypes in DUI species (>10 kb), as well as the highest mtDNA divergences (sometimes reaching >50%). An important in-frame insertion (>3.5 kb) in the male cox2 gene is partly responsible for the differences in genome size. The S. plana cox2 gene is the largest reported so far in the Kingdom Animalia. The mitogenomes may be carrying sex-specific genes, indicating that general mitochondrial features are shared among DUI species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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