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Enregistrement W3002186531 · doi:10.1021/acssynbio.9b00399

Synthetic Derivatives of (+)-<i>epi</i>-α-Bisabolol Are Formed by Mammalian Cytochromes P450 Expressed in a Yeast Reconstituted Pathway

2020· article· en· W3002186531 sur OpenAlexaff
Arthur Sarrade-Loucheur, Dae‐Kyun Ro, Régis Fauré, Magali Remaud‐Siméon, Gilles Truan

Notice bibliographique

RevueACS Synthetic Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMinistère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation
Mots-clésCytochrome P450BiochemistryEnzymeYeastChemistryReductaseBiosynthesisNatural productBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identification of the enzyme(s) involved in complex biosynthetic pathways can be challenging. An alternative approach might be to deliberately diverge from the original natural enzyme source and use promiscuous enzymes from other organisms. In this paper, we have tested the ability of a series of human and animal cytochromes P450 involved in xenobiotic detoxification to generate derivatives of (+)- epi -α-bisabolol and attempt to produce the direct precursor of hernandulcin, a sweetener from Lippia dulcis for which the last enzymatic steps are unknown. Screening steps were implemented in vivo in S. cerevisiae optimized for the biosynthesis of oxidized derivatives of (+)- epi -α-bisabolol by coexpressing two key enzymes: the (+)- epi -α-bisabolol synthase and the NADPH cytochrome P450 reductase. Five out of 25 cytochromes P450 were capable of producing new hydroxylated regioisomers of (+)- epi -α-bisabolol. Of the new oxidized bisabolol products, the structure of one compound, 14-hydroxy-(+)- epi -α-bisabolol, was fully elucidated by NMR while the probable structure of the second product was determined. In parallel, the production of (+)- epi -α-bisabolol derivatives was enhanced through the addition of a supplementary genomic copy of (+)- epi -α-bisabolol synthase that augmented the final titer of hydroxylated product to 64 mg/L. We thus demonstrate that promiscuous drug metabolism cytochromes P450 can be used to produce novel compounds from a terpene scaffold.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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