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Enregistrement W3002857424 · doi:10.1111/febs.15220

New regulatory mechanism‐based inhibitors of aspartate transcarbamoylase for potential anticancer drug development

2020· article· en· W3002857424 sur OpenAlexafffund
Zhen Lei, Biying Wang, Zhifang Lu, Nan Wang, Hongwei Tan, Jimin Zheng, Zongchao Jia

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAspartate carbamoyltransferasePyrimidine metabolismAllosteric regulationBiochemistryActive siteBiologyDrug discoveryEnzymePurine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspartate transcarbamoylase (ATCase) is a key enzyme which regulates and catalyzes the second step of de novo pyrimidine synthesis in all organisms. Escherichia coli ATCase is a prototypic enzyme regulated by both product feedback and substrate cooperativity, whereas human ATCase is a potential anticancer target. Through structural and biochemical analyses, we revealed that R167/130's loop region in ATCase serves as a gatekeeper for the active site, playing a new and unappreciated regulatory role in the catalytic cycle of ATCase. Based on virtual compound screening simultaneously targeting the new regulatory region and active site of human ATCase, two compounds were identified to exhibit strong inhibition of ATCase activity, proliferation of multiple cancer cell lines, and growth of xenograft tumors. Our work has not only revealed a previously unknown regulatory region of ATCase that helps uncover the catalytic and regulatory mechanism of ATCase, but also successfully guided the identification of new ATCase inhibitors for anticancer drug development using a dual-targeting strategy. DATABASE: Structure data are available in Protein Data Bank under the accession numbers: 6KJ7 (G166P ecATCase), 6KJ8 (G166P ecATCase-holo), 6KJ9 (G128/130A ecATCase), and 6KJA (G128/130A ecATCase-holo).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,160
Score d'incertitude au seuil0,486

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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