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Enregistrement W3003695501 · doi:10.1186/s12868-018-0451-y

27th Annual Computational Neuroscience Meeting (CNS*2018): Part Two

2018· article· en· W3003695501 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueBMC Neuroscience · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurology and Historical Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome CentreBaycrest Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and Stroke
Mots-clésNeuroscienceComputational neuroscienceCognitive scienceNeuroinformaticsPsychologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

benefit from a separation of model parameters and implementation. To address these issues, we re-implemented the model using NetPyNE (www.netpy ne.org), a high-level Python interface to the NEURON simulator, which facilitates the development, parallel simulation and analysis of biological neuronal networks [6]. NetPyNE employs a standardized declarative format to describe the model specifications, and can then generate an efficiently parallelized NEU-RON model. It also provides a large number of analysis functions that enable further exploration of the model and allows exportation to NeuroML, a standard format for computational models. Our Net-PyNE implementation is able to reproduce the results of the original model, but using a clean and powerful declarative language, which makes this complex model accessible to a wider community of neuroscientists. Furthermore, we analyse and explore the model in new ways, including connectivity analysis, computation of LFP spectra and information flow. We also perform novel manipulations to elucidate the relation between neuronal and synaptic loss, involved in Alzheimer's disease, and memory recall performance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesÉtudes des sciences et des technologies
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,779
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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