Hypoxia-Inducible Factor 1 is required for hypoxia-induced resistance to doxorubicin in breast carcinoma cells
Notice bibliographique
Résumé
1711 Background: The Hedgehog (HH) pathway signals via Patched (PTCH) and Smoothened (SMO) at the cell surface to GLI in the nucleus. It is known to be required for cell differentiation and organ formation during embryogenesis. Deregulation of HH signaling due to mutations in PTCH or SMO is seen in medulloblastomas and basal cell carcinomas. In a previous microarray-based comparison of expression profiles of 46 synovial sarcoma (SS) samples and 137 samples of 4 other translocation-associated sarcomas (Ewing sarcoma, alveolar rhabdomyosarcoma, desmoplastic small round cell tumor, alveolar soft part sarcoma), we observed features of HH pathway activation in SS, specifically GLI and SMO were significantly overexpressed, as were some downstream targets of GLI such as WIF1 and PDGFRA. We therefore performed a mutational and functional analysis of the HH signaling pathway in SS. Design: Mutational analysis was performed on all coding exons of PTCH and SMO in 40 SS samples and 3 SS cell lines (FUJI, HS-SY-II, SYO-1) by direct sequencing. We also examined the changes in cell growth and in expression of HH target genes and of SUFU, a member of intracellular GLI complex, upon blockade of HH signaling by cyclopamine, a specific inhibitor of SMO, in the 3 SS cell lines. . Result: The mutational analysis revealed no somatic mutations in PTCH and SMO in the 40 SS samples and the 3 SS cell lines. By RT-PCR, all three cell lines expressed GLI, GLI2, GLI3, SUFU, SMO and PTCH. There was a wide range of sensitivity to cyclopamine among 3 cell lines: FUJI cells were most sensitive, with an IC50 (50% reduction in cell counts relative to untreated cells) between 1 uM and 5 uM whereas SYO-1 cells were less sensitive (IC50: 10 uM), and HS-SY-II cells were resistant (IC50>10 uM). We also examined the effect of cyclopamine on genes reported to be transcriptionally up-regulated by HH signaling in other cell types (GLI, PTCH, BCL2, PDGFRA, BMP4, BMP7, CRLF1, SOX9, WIF1, WNT5A). Quantitative RT-PCR assays showed decreases of 80%, 60%, and 30% in the expression levels of GLI, PTCH and BMP4, respectively, relative to untreated cells in the FUJI cell line (p
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».