Attenuation of bile acid-mediated FXR and PXR activation in patients with Crohn’s disease
Notice bibliographique
Résumé
Bile acids are endogenous ligands of nuclear receptors pregnane X (PXR) and farnesoid X (FXR). PXR and FXR regulate pathways that are impaired in inflammatory bowel disease (IBD). Decreases in PXR and FXR activity are documented in IBD; however reasons for this are unknown. We aimed to assess the effect of Crohn's disease (CD) on the plasma bile acid composition in vivo and the resultant impact on PXR and FXR activation. A cross-sectional study evaluated the plasma concentrations of 12 bile acids in addition to 4β-hydroxycholesterol (4βOHC), an in vivo probe of the PXR target-gene cytochrome 3A4 (CYP3A4) and the FXR target-gene, fibroblast growth factor (FGF) 19 in individuals with (n = 74) and without (n = 71) CD. An in vitro model was used to assess the impact of CD-specific changes in the plasma bile acid composition on PXR and FXR activation. Decreases in glycochenodeoxycholic acid, taurocholic acid and lithocholic acid were seen in CD with increases in glycodeoxycholic acid and glycocholic acid relative to the total plasma bile acid profile. In vitro, increasing concentrations of bile acids applied in the same ratio as seen in the study cohorts resulted in decreased activation of both PXR and FXR in the CD model. In vivo, plasma 4βOHC (CD = 18.68 ng/ml ± 13.02 ng/ml, non-CD = 46.38 ng/ml ± 40.70 ng/ml, p ≤ 0.0001) and FGF19 (CD = 0.276 pg/L ± 0.189 pg/L, non-CD = 0.485 pg/L ± 0.42 pg/L, p = 0.0002) concentrations were lower in CD versus controls. Ultimately, CD-specific changes in the plasma bile acid composition lead to reduced activation of FXR and PXR target genes in vitro and in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».