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Enregistrement W3004666955 · doi:10.1113/jp279307

Arrhythmia mutations in calmodulin can disrupt cooperativity of Ca<sup>2+</sup> binding and cause misfolding

2020· article· en· W3004666955 sur OpenAlexafffund
Kaiqian Wang, Malene Brohus, Christian Holt, Michael T. Overgaard, Reinhard Wimmer, Filip Van Petegem

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Research Council CanadaNovo Nordisk FondenWestern Economic Diversification CanadaNovo NordiskH. Lundbeck A/SLundbeckfondenAalborg UniversitetDanmarks Frie ForskningsfondCanadian Light Source
Mots-clésCalmodulinRyanodine receptorCooperativityMutantMutationEF handVoltage-dependent calcium channelBinding domainChemistryBinding siteCalcium channelBiophysicsBiologyCalciumCell biologyBiochemistryReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Key points Mutations in the calmodulin protein (CaM) are associated with arrhythmia syndromes. This study focuses on understanding the structural characteristics of CaM disease mutants and their interactions with the voltage‐gated calcium channel CaV1.2. Arrhythmia mutations in CaM can lead to loss of Ca2+ binding, uncoupling of Ca2+ binding cooperativity, misfolding of the EF‐hands and altered affinity for the calcium channel. These results help us to understand how different CaM mutants have distinct effects on structure and interactions with protein targets to cause disease. Abstract Calmodulinopathies are life‐threatening arrhythmia syndromes that arise from mutations in calmodulin (CaM), a calcium sensing protein whose sequence is completely conserved across all vertebrates. These mutations have been shown to interfere with the function of cardiac ion channels, including the voltage‐gated Ca2+ channel CaV1.2 and the ryanodine receptor (RyR2), in a mutation‐specific manner. The ability of different CaM disease mutations to discriminate between these channels has been enigmatic. We present crystal structures of several C‐terminal lobe mutants and an N‐terminal lobe mutant in complex with the CaV1.2 IQ domain, in conjunction with binding assays and complementary structural biology techniques. One mutation (D130G) causes a pathological conformation, with complete separation of EF‐hands within the C‐lobe and loss of Ca2+ binding in EF‐hand 4. Another variant (Q136P) has severely reduced affinity for the IQ domain, and shows changes in the CD spectra under Ca2+‐saturating conditions when unbound to the IQ domain. Ca2+ binding to a pair of EF‐hands normally proceeds with very high cooperativity, but we found that N98S CaM can adopt different conformations with either one or two Ca2+ ions bound to the C‐lobe, possibly disrupting the cooperativity. An N‐lobe variant (N54I), which causes severe stress‐induced arrhythmia, does not show any major changes in complex with the IQ domain, providing a structural basis for why this mutant does not affect function of CaV1.2. These findings show that different CaM mutants have distinct effects on both the CaM structure and interactions with protein targets, and act via distinct pathological mechanisms to cause disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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