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Enregistrement W3005235125 · doi:10.1016/j.nicl.2020.102209

Genome-wide association study of white matter hyperintensity volume in elderly persons without dementia

2020· article· en· W3005235125 sur OpenAlexfundno aff
Yu Guo, Xue‐Ning Shen, Xiao‐He Hou, Ya‐Nan Ou, Yuyuan Huang, Qiang Dong, Lan Tan, Jin‐Tai Yu

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGE HealthcareNational Key Research and Development Program of ChinaJohnson and JohnsonJanssen Research and DevelopmentNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SGenentechIXICONational Natural Science Foundation of ChinaNorthern California Institute for Research and EducationU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeUniversity of Southern CaliforniaMerckNational Institute on AgingFujirebio EuropeScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityFudan University
Mots-clésGenome-wide association studyDementiaMinor allele frequencyGenetic associationHyperintensitySingle-nucleotide polymorphismGeneticsAlleleBiologyMedicineAllele frequencyDiseaseGeneInternal medicineGenotypeMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

White matter hyperintensity has been correlated with cognitive disorders and its genetic predictors remain unclear. Here we conducted a genome-wide association study to identify novel genetic determinants that were correlated with white matter hyperintensity volume (WMHV) among non-demented elders. Three hundred and fifty non-Hispanic Caucasian subjects aged 55–80 years were included from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative cohort. Associations of WMHV with genetic polymorphisms were explored using multiple linear regression under an additive genetic model. Further studies were conducted to explore the influence of genetic variants on cognition-related phenotypes. Rs7220676 near HS3ST3A1 and MIR548H3 genes was associated with WMHV levels at genome-wide significance (P = 2.96 × 10−8). Single nucleotide polymorphisms comprising rs9675262 (near HS3ST3A1 and MIR548H3 genes, P = 1.15 × 10−7), rs9820240 (in DCLK3 gene, P = 2.23 × 10−7), rs10916409 (near ISCA1P2 gene, P = 4.55 × 10−6), and rs540422 (in PICALM gene, P = 9.68 × 10−6) were identified as suggestive loci linked to WMHV levels. The minor allele of rs7220676 (C) showed association with lower log (WMHV) in a dose-dependent manner. Besides, rs7220676 was correlated with rates of cognitive decline assessed by Mini-mental State Examination and memory scores. A novel locus near HS3ST3A1 and MIR548H3 genes was associated with WMHV levels and it may be involved in neurodegenerative diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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