Caracterización molecular de cepas de Penicillium expansum de manzanas provenientes de España y Argentina
Notice bibliographique
Résumé
La manzana (Malus domestica) es una de las frutas mas consumidas a nivel global. En Argentina la principal zona de produccion esta localizada en el Alto Valle de Rio Negro, seguida por Neuquen y Mendoza, mientras que en Espana se centra en Cataluna, Aragon y Galicia. En ambos paises es una de las principales frutas de exportacion e industrializacion. El control de calidad de las manzanas, fundamentalmente en la postcosecha, es critico, ya que es donde comunmente se produce la enfermedad del “moho azul” causada por Penicillium expansum. Esta enfermedad causa grandes perdidas economicas debido al deterioro de la fruta y la produccion de patulina, que es una micotoxina. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la existencia de diferencias morfologicas entre aislamientos de Penicillium expansum de diferente origen geografico y evaluar la utilidad de diferentes marcadores moleculares para caracterizar su diversidad genetica. Se estudiaron, 59 aislamientos de Argentina y 55 de Espana, que fueron caracterizados morfologicamente y molecularmente mediante el analisis filogenetico de secuencias del gen ITS (rRNA 16S y 23S) y dos regiones del gen β-tubulina (Bt2a-Bt2b y Bt-T2m-Up - Bt-LEV-Lo1). La caracterizacion morfologica no mostro diferencias entre los aislamientos espanoles y argentinos. Las secuencias de los genes ITS y beta tubulina (Bt2a x Bt2b) no presentaron variabilidad entre los aislamientos de Argentina y Espana. Las secuencias obtenidas con los primers Bt-T2m-Up y Bt-LEV-Lo1 de 31 aislamientos espanoles y 36 argentinos mostraron diferencias entre los mismos, y los polimorfismos revelaron 30 haplotipos. Los aislamientos de Argentina se diferenciaron en 14 haplotipos mientras que los aislamientos espanoles se separaron en 16 haplotipos. Algunos haplotipos presentaron una amplia distribucion mundial (Argentina, Espana y Canada) con variaciones en su abundancia relativa mientras que otros solo se detectaron en Argentina o en Espana. El analisis de los haplotipos permitio identificar la forma en que se distribuye esta diversidad. Los indices de diversidad de Shannon (H´=2,142; H´=2,402) y Simpson (SiD=0,859; SiD=0,895) para aislamientos argentinos y espanoles respectivamente, indican que la diversidad de Penicillium expansum en Espana es mayor que en Argentina. Esta distribucion podria explicarse tanto por la existencia de intercambio de haplotipos entre distintos paises, asi como por la existencia de haplotipos adaptados a las condiciones ambientales o a los genotipos de las manzanas cultivadas en cada region u origenes geograficos.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».