Genetic diversity of Plum pox virus in Ukraine
Notice bibliographique
Résumé
Aim. Establishing the genetic diversity of Plum pox virus (PPV) in Ukraine. Methods. Double antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA), polymerase chain reaction with reverse transcription (RT-PCR), DNA sequencing and phylogenetic analysis. Results. The samples with visual symptoms of virus infection were collected from different regions of Ukraine and diagnosed using DAS-ELISA. The amplicons of the coat protein (CP) gene were obtained using RT-PCR and sequenced. The obtained viral cDNAs were analyzed using phylogenetic methods to elucidate the genetic diversity of PPV in different regions of Ukraine. The phylogenetic relationships between Ukrainian isolates were studied and compared to PPV isolates from neighboring countries. Conclusions. The PPV strains M and D circulate in Ukraine. For the first time, PPV was found in the Kharkiv region. The PPV isolates circulating in Ukraine are similar to the isolates from Germany, Turkey, Hungary, and Canada. The results can be used to predict the spread of the virus in different Ukrainian regions and in neighboring countries and to establish its origin and predict the development of possible epidemics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».