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Enregistrement W3006893670 · doi:10.1101/2020.02.26.965533

Immunotherapy efficacy in colorectal cancer is dependent on activation of a microbial-metabolite-immune circuit

2020· preprint· en· W3006893670 sur OpenAlexafffund
Lukas F. Mager, Regula Burkhard, Noah C.A. Cooke, Kirsty Brown, Hena R. Ramay, Seungil Paik, John Stagg, Ryan A. Groves, Marco Gallo, Ian A. Lewis, Markus B. Geuking, Kathy D. McCoy

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de MontréalAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchInternational Microbiome Centre, University of CalgarySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungCumming School of Medicine, University of CalgaryAlberta InnovatesCanterbury Medical Research FoundationNational Science Foundation
Mots-clésImmunotherapyColorectal cancerImmune checkpointBlockadeImmune systemCancerCancer researchCancer immunotherapyInosineTumor microenvironmentBiologyMedicineImmunologyAdenosineInternal medicineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Cancer is a leading cause of death globally. Checkpoint blockade therapies offer a promising treatment for many cancers, but have been ineffective for colorectal cancers. Previous studies have shown a dependency of immunotherapies on the microbiota. Consequently, we hypothesized that specific gut bacteria promote immunotherapy for colorectal cancer. We identify three commensal bacteria and a microbial metabolite, inosine, that enhance the efficacy of immune checkpoint blockade therapy in colorectal cancer. We show that inosine interacts with the adenosine A 2A receptor on T cells resulting in intestinal Th1 cell differentiation. Decreased gut barrier function induced by immunotherapy increased the translocation of bacterial metabolites and promoted cancer protective Th1 cell activation. This microbial-metabolite-immune circuit provides a mechanism for a new class of bacteria-enhanced checkpoint blockade therapies. The efficacy of this mechanism differs among colorectal cancer subtypes and highlights the strengths as well as potential limitations of this novel bacterial co-therapy for cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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