Expression of circulating miR375 and miR371 to differentiate teratoma and viable germ cell tumor in patients with post-chemotherapy residual disease.
Notice bibliographique
Résumé
414 Background: Viable germ cell tumors (vGCT) express high levels of certain circulating microRNAs, including miR-371a-3p (miR371) that has shown high specificity and sensitivity. However, neither tissue nor serum/plasma from patients with only teratoma are miR371 positive. miR375 is overexpressed in teratoma tissue, but detectability in blood is unknown. Methods: miR371 and miR375 expression was analyzed in 100 patients with various stages and histology of GCT. miR375 expression in teratoma was validated in patients with post-chemotherapy pathologically confirmed teratoma (PCPCT). The miRNAs expression was assessed by RT-PCR and quantified by ΔΔCT method. The optimal cut-off for miR375 expression was estimated by Youden index ( > 20). Spike-in cel-miR-39-3p, miR-451 and miR-30b-5p were used as internal controls. Sensitivity, specificity, AUC of the ROC of miR375 in detecting teratoma was analyzed. Results: In the discovery cohort miR371 and miR375 were measured in 62 pts: 27 CSI NED, 15 chemo-naïve metastatic seminoma and 20 with PCPCT. miR375 was over-expressed in pts with teratoma compared to CSI and seminoma pts (p = 0.002), while miR371 was expressed in the seminoma pts and undetectable in the PCPCT and CSI pts (p < 0.001). In the post-chemotherapy setting, 38 pts were analyzed: 21 PCPCT, 6 vGCT and 11 complete remission (CR). Also in this cohort, miR375 was over-expressed in pts with teratoma compared to the pts presenting vGCT and post-chemotherapy CR (p = 0.01), while miR371 was detectable only in the pts with vGCT (p < 0.001). Overall, sensitivity and specificity of miR375 in identifying teratoma were 78% and 80%, respectively; the AUC was 0.7 (95% CI: 0.5490-0.8186; p < 0.01). Conclusions: Pts with residual post-chemotherapy teratoma present higher plasma levels of miR375 compared to pts with vGCT in whom miR375 is low but miR371 is expressed at high levels. The simultaneous evaluation of miR371 and miR375 may be clinically useful to predict the histology of the GCT components in pts with post-chemotherapy residual disease to inform the best therapeutic options (surgery or chemotherapy). Further validation within larger studies is warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».