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Enregistrement W3007312897 · doi:10.1111/mmi.14496

Species‐specific secretion of ESX‐5 type VII substrates is determined by the linker 2 of EccC <sub>5</sub>

2020· article· en· W3007312897 sur OpenAlexaff
Catalin M. Bunduc, Roy Ummels, Wilbert Bitter, Edith N. G. Houben

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésBiologyMycobacterium marinumSecretionVirulenceLinkerMicrobiologyMycobacterium tuberculosisBiochemistryGeneticsMycobacteriumTuberculosisGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mycobacteria use type VII secretion systems (T7SSs) to translocate a wide range of proteins across their diderm cell envelope. These systems, also called ESX systems, are crucial for the viability and/or virulence of mycobacterial pathogens, including Mycobacterium tuberculosis and the fish pathogen Mycobacterium marinum . We have previously shown that the M. tuberculosis ESX‐5 system is unable to fully complement secretion in an M. marinum esx‐5 mutant, suggesting species specificity in secretion. In this study, we elaborated on this observation and established that the membrane ATPase EccC 5 , possessing four (putative) nucleotide‐binding domains (NBDs), is responsible for this. By creating M. marinum ‐ M. tuberculosis EccC 5 chimeras, we observed both in M. marinum and in M. tuberculosis that secretion specificity of PE_PGRS proteins depends on the presence of the cognate linker 2 domain of EccC 5 . This region connects NBD1 and NBD2 of EccC 5 and is responsible for keeping NBD1 in an inhibited state. Notably, the ESX‐5 substrate EsxN, predicted to bind to NBD3 on EccC 5 , showed a distinct secretion profile. These results indicate that linker 2 is involved in species‐specific substrate recognition and might therefore be an additional substrate recognition site of EccC 5 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,496

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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