Interaction of field realistic doses of clothianidin and Varroa destructor parasitism on adult honey bee (Apis mellifera L.) health and neural gene expression, and antagonistic effects on differentially expressed genes
Notice bibliographique
Résumé
While many studies have examined the effects of neonicotinoid insecticides and the parasitic mite Varroa destructor on honey bees (Apis mellifera), more information on the combined effects of such stressors on gene expression, including neural related genes, and their impact on biological pathways is needed. This study analyzed the effects of field realistic concentrations of the neonicotinoid clothianidin on adult bees infested and not infested with V. destructor over 21 consecutive days and then determined bee survivorship, weight, deformed wing virus (DWV) levels and gene expression. V. destructor parasitism with or without clothianidin exposure was significantly associated with decreased survivorship, weight loss and higher DWV levels, while clothianidin exposure was only associated with higher levels of DWV. Expression analysis of the neural genes AmNlg-1, BlCh and AmAChE-2 showed that V. destructor caused a significant down-regulation of all of them, whereas clothianidin caused a significant down-regulation of only AmNrx-1 and BlCh. An interaction was only detected for AmNrx-1 expression. RNAseq analysis showed that clothianidin exposure resulted in 6.5 times more up-regulated differentially expressed genes (DEGs) than V. destructor alone and 123 times more than clothianidin combined with V. destructor. Similar results were obtained with down-regulated DEGs, except for a higher number of DEGs shared between V. destructor and the combined stressors. KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) biological pathway analysis of the DEGs showed that the stressor linked to the highest number of KEGG pathways was clothianidin, followed by V. destructor, and then considerably fewer number of KEGG pathways with the combined stressors. The reduced numbers of DEGs and KEGG pathways associated with the DEGs for the combined stressors compared to the stressors alone indicates that the interaction of the stressors is not additive or synergistic, but antagonistic. The possible implications of the antagonistic effect on the number of DEGs are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».