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Enregistrement W3007545260 · doi:10.1093/jcag/gwz047.017

A18 BUILDING BETTER ENTEROIDS: A NOVEL STRATEGY FOR ENRICHING SECRETORY EPITHELIAL CELL SUBTYPES

2020· article· en· W3007545260 sur OpenAlexaff
Emily Davies, Shauna M. Crowley, Kan-Jen Tsai, Mariel Gómez, Xinyun Han, Bruce A. Vallance

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBurnaby HospitalBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayEnteroendocrine cellBiologyCell biologyGoblet cellIntestinal epitheliumFlow cytometrySecretionMucusEnterocyteImmunologyEpitheliumSignal transductionEndocrinologyHormoneEndocrine systemSmall intestine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Inflammatory bowel diseases (IBD) are chronic gastrointestinal disorders that affect more than 270,000 Canadians, including over 7,000 children. Inflammation arising from IBD severely damages intestinal epithelial cells (IECs), however their role in disease pathogenesis is not fully understood, in part due to a lack of in vitro systems that recapitulate the epithelium’s complex cellular composition. Enteroids are an in vitro model where primary IECs are isolated and cultured as 3D ‘mini guts.’ They offer distinct advantages over cell lines, however current protocols generate enteroids primarily composed of enterocytes that seldom contain rarer IEC subtypes (goblet, enteroendocrine, tuft and Paneth cells). These cells are responsible for the gut’s mucus, antimicrobial and hormone secretory functions, yet their role in the pathophysiology of IBD is unclear. Aims Manipulate cell differentiation pathways in mouse and human enteroids to increase the prevalence of secretory IECs, as well as determine if enteroids derived from pediatric IBD patients exhibit impaired responses to differentiation treatments. Methods Mouse enteroids were derived from ileal, cecal and colonic crypts of C57BL/6 mice while human enteroids were isolated from healthy or pediatric IBD patient intestinal biopsies. Enteroids were initially supplemented with Wnt signaling activators and the extracellular matrix modified to enhance enteroid culture “stemness”. Differentiation was induced by growth media modulation of the Notch and Wnt signaling pathways. Enteroids were analyzed via flow cytometry to quantify expression of secretory cell markers, while immunofluorescent and Peroidic acid Schiff/Alcian Blue staining was used to visualize goblet cells. Results “Stem” treatment potentiated Wnt signaling and enhanced enteroid “stemness” as measured by Lgr5 and CD44 expression. Comparatively, differentiation of these “stem” enteroids led to a larger relative increase in secretory markers. Differentiation treatment increased expression of goblet cell markers (Muc2 and lectin) in the “stem” treated mouse cecal and colonic enteroids, but not in ileal enteroids. Notch inhibition produced increased expression of lysozyme, a Paneth cell marker, in all enteroids. A similar increase in secretory cell numbers was observed in control human enteroids following differentiation treatment. In contrast, enteroids derived from pediatric IBD patients displayed irregular differentation responses to treatment. Conclusions We demonstrate that manipulation of cell differentiation pathways increases the number of secretory IEC subtypes within enteroids. Furthermore, these pro-secretory cell responses differ in IBD patient enteroids, indicating that an alteration of the targeted cell signaling pathways may be linked to IBD pathogenesis. Funding Agencies CCC, CIHRBCCHRI Summer Studentship

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,472
Score d'incertitude au seuil0,894

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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