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Enregistrement W3007605981 · doi:10.1093/jcag/gwz047.041

A42 MICROBIAL METABOLISM OF DIETARY TRYPTOPHAN ENHANCES ARYL HYDROCARBON RECEPTOR ACTIVATION: IMPLICATIONS FOR IBD

2020· article· en· W3007605981 sur OpenAlexaff
L Rondeau, Alexandra Clarizio, Jennifer Jury, D L Gibson, P Bercík, Harry Sokol, A Caminero Fernandez

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensOkanagan University CollegeUniversity of British Columbia, Okanagan CampusMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorImmune systemColitisInflammatory bowel diseaseGut floraPathogenesisBiologyImmunologyMucinMicrobiologyChemistryInternal medicineMedicineBiochemistryTranscription factorDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Intestinal immune homeostasis is maintained by the interplay between microbiota and the mucosal immune system. Changes in gut microbiota have been associated with chronic intestinal conditions, such as inflammatory bowel disease (IBD). The aryl hydrocarbon receptor (AhR) is a transcription factor that is activated by dietary and environmental stimuli to control immune responses in the gut and homeostatic mechanisms at mucosal surfaces. In IBD, AhR expression is downregulated. Major agonists of AhR in the gut include microbial tryptophan metabolites such as indole derivatives, which are decreased in IBD patients. The mechanisms involved in tryptophan metabolism by bacteria and their implications in AhR activation and thus IBD pathogenesis are not well understood. Aims To investigate whether tryptophan metabolism by intestinal bacteria participates in AhR activation and IBD pathogenesis. Methods Microbiota profiles (16S rRNA Illumina) and activation of AhR (luciferase reporter assay) were determined in fecal samples from IBD patients (n=10) and healthy volunteers (n=10). Germ-free C57BL/6 mice were colonized with fecal slurries of 2 healthy subjects and 4 IBD patients (n=4 mice/donor) by oral gavage (humanized-mice). All mice were fed irradiated tryptophan diets with 0.1% or 1% tryptophan content for 14 days. Simultaneously, SPF Mucin 2 (Muc2) deficient mice (C57BL/6 background), which develop colitis spontaneously, were fed tryptophan diets (0.1%, 0.3% and 1% content). Activation of AhR was measured in feces using an AhR luciferase reporter assay. Inflammation was determined by immunohistochemistry and the characterization of immune infiltrate in colon cross-sections. Bacteria from human and mouse fecal samples were isolated and screened for their ability to produce indoles using biochemical reagents. Positive bacteria were identified by colony PCR and 16S rRNA Sanger sequencing. Results IBD patients had an altered fecal microbiota with a lower capacity to activate AhR compared to healthy subjects. Colonization of mice with microbiota from healthy subjects induced greater activation of AhR compared to mice colonized with microbiota from patients with IBD. Furthermore, increasing dietary tryptophan composition rescued the capacity to activate AhR. In Muc2 deficient mice, dietary tryptophan treatment enhanced AhR activation capacity and reduced infiltration of innate immune cells before the onset of colitis. Several AhR agonist producing bacterial species were identified and will be used in future experiments. Conclusions Activation of AhR is dependent on the gut microbiota and disease status of the donor. Dietary intervention with tryptophan enhances AhR activation capacity and may be a potential therapeutic avenue in IBD individuals with intestinal dysbiosis. Funding Agencies Farncombe Family Digestive Health Research Institute, Biocodex Microbiota Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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