Modeling Epithelial Homeostasis and Reactive Epithelial Changes in Human and Murine Three‐Dimensional Esophageal Organoids
Notice bibliographique
Résumé
The homeostatic proliferation-differentiation gradient in the esophageal epithelium is perturbed under inflammatory disease conditions such as gastroesophageal reflux disease and eosinophilic esophagitis. Herein we describe the protocols for rapid generation (<14 days) and characterization of single-cell-derived, three-dimensional (3D) esophageal organoids from human subjects and mice with normal esophageal mucosa or inflammatory disease conditions. While 3D organoids recapitulate normal epithelial renewal, proliferation, and differentiation, non-cell autonomous reactive epithelial changes under inflammatory conditions are evaluated in the absence of the inflammatory milieu. Reactive epithelial changes are reconstituted upon exposure to exogenous recombinant cytokines. These changes are modulated pharmacologically or genetically ex vivo. Molecular, structural, and functional changes are characterized by morphology, flow cytometry, biochemistry, and gene expression analyses. Esophageal 3D organoids can be translated for the development of personalized medicine in assessment of individual cytokine sensitivity and molecularly targeted therapeutics in esophagitis patients © 2020 by John Wiley & Sons, Inc. Basic Protocol 1: Generation of esophageal organoids from biopsy or murine esophageal epithelial sheets Basic Protocol 2: Propagation and cryopreservation of esophageal organoids Basic Protocol 3: Harvesting of esophageal organoids for RNA isolation, immunohistochemistry, and evaluation of 3D architecture Basic Protocol 4: Modeling of reactive epithelium in esophageal organoids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».