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Enregistrement W3008148985 · doi:10.1093/jcag/gwz047.050

A51 UTILIZING MUCIN-DERIVED SUGARS CONFERS A FITNESS ADVANTAGE TO THE ENTERIC PATHOGEN CITROBACTER RODENTIUM THAT PROMOTES INTESTINAL COLONIZATION

2020· article· en· W3008148985 sur OpenAlexaff
M Mslati, Qiaochu Liang, Haitao Yu, Chenhui Ma, Bruce A. Vallance

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitrobacter rodentiumMicrobiologyBiologyPathogenMucusCecumSialic acidBiochemistryEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Citrobacter rodentium is an enteric murine pathogen used to model the human diarrheal pathogens. Following inoculation, C. rodentium colonizes the mouse cecum where it expands and ultimately spreads to the distal colon. During this process, C. rodentium has to compete with commensal microbes for available nutrients. Moreover, to spread throughout the gut, and infect the intestinal epithelium, C. rodentium has to cross through, and or dwell within the intestinal mucus layer which is composed of the heavily glycosylated protein Muc2. Muc-2 is glycosylated and coated by 5 distinct terminal sugar residues: galactose, N-acetylgalactosamine, N-acetylglucosamine, fucose, and sialic acid. Many commensal microbes have the ability to cleave and free these sugars from the Muc2 protein, releasing them for their own consumption, however pathogens appear to exploit this process. While studies have indicated that C. rodentium uses these terminal sugar residues as a nutritional source, their relative importance in the pathogenic strategy of C. rodentium (and other gut pathogens) remains unclear Aims Investigate the role played by mucin sugar residues in controlling C. rodentium pathogenesis Methods Deletions of agaW, nagE, mglB, galP, fucK, and nanT were generated on the chromosome of C. rodentium (Strepr) by overlap extension PCR. Growth assays were performed to examine the growth kinetics of mutants C. rodentium in minimal (M9) media supplemented with one of the 5 mucin sugars or M9 with whole mucin as control. Specific pathogen free (SPF) C57BL/6 mice, or germfree C57BL/6 mice were orally gavaged with wildtype C. rodentium (Strepr) or one of ΔagaW, ΔnagE, ΔmglB, ΔgalP, ΔfucK, or ΔnanT strains. Mice were euthanized at 6 days post-infection, and the cecum, colon, and spleen were collected and histologically scored for pathology and intestinal and systemic bacterial burden. Stool samples were collected throughout the 6 days to quantify C. rodentium burdens Results Growth assays confirmed that the specific sugar transporter/kinase mutant C. rodentium strains grew normally when placed in media supplemented with whole mucin, or with most sugars, only showing overt defects in growth when solely supplemented with the sugar for which they were impaired. Several of the C. rodentium mutants including ΔnanT showed overt defects in colonization/infection of SPF C57BL/6 mice, but their pathogenesis was normalized in germfree mice, or in mice treated with the antibiotic streptomycin at each day post-infection. These findings indicate that the impact of mucin sugar utilization on C. rodentium virulence is microbiota-dependent Conclusions C. rodentium uses mucin sugars as nutrient source in the mouse gut, and an inability to use these sugars impairs their ability to infect their hosts in a microbiota dependent manner Funding Agencies CAG, CCC, CIHR, NRC

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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