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Enregistrement W3008154817 · doi:10.1093/jcag/gwz047.013

A14 GUT-RESIDING BACTERIA CAN SHAPE HOST DRUG METABOLISM IN THE SMALL INTESTINE THROUGH AN INNATE LYMPHOID CELL-IL-22 DRIVEN AXIS

2020· article· en· W3008154817 sur OpenAlexaff
Kyle L. Flannigan, Michael J. Johnston, Sarah L. Erickson, Kimberly Nieves, Humberto Jijon, Marco Gallo, Kathy D. McCoy, Simon A. Hirota

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDrug metabolismMetabolismCYP3A4Cytochrome P450Innate immune systemEnzymeCell biologyMicrobiologyImmune systemImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The ability of the intestinal microbiota to influence drug metabolism has been recognized, however the mechanisms through which this occurs remain unexplored. Recent work in germ-free mice showed that conventionalization with specific pathogen free (SPF) microbiota influences the expression of cytochrome P450 (CYP) enzymes in the liver and small intestine (SI), two important sites of drug metabolism. Given that CYP enzymes, including CYP3A11 in mice, account for roughly 70% of total drug metabolism, we hypothesized that commensal gut bacteria can shape the CYP landscape to influence drug metabolism and therapeutic outcomes. Aims To investigate the role of specific gut-residing microbes in shaping the expression and activity of host drug metabolism enzymes. Methods Segmented filamentous bacteria (SFB)-free mice were obtained from Jackson Lab (Jax) and colonized with feces from SFB-mono-associated mice via oral gavage. 14 days later, expression of drug metabolism enzymes in the SI were probed using PCR arrays, and lamina propria cells isolated for flow cytometry. A monoclonal antibody for Thy1.2 was used to deplete innate lymphoid cells (ILCs) in RAG1-/- mice (lacking T- and B-cells). CYP3A11 activity was determined through the colorimetric breakdown of the CYP3A11-specific substrate 7-benzyloxyresorufin. SI organoids were generated from mice and humans, and treated with IL-22 to further assess the dynamics of CYP3A11/CYP3A4 expression and activity. Results Colonization of Jax mice with immunomodulatory SFB altered the expression of various CYP enzymes in the SI (but not liver), with Cyp3a11 being the most downregulated gene. Further analysis showed that SFB-induced IL-22 production by type 3 ILCs (ILC3) correlated with reduced SI Cyp3a11 expression. Additionally, SFB colonization had no effect on the expression of Cyp3a11 in the SI of mice in which ILCs were depleted. Both SFB colonization and administration of IL-23, to induce IL-22 from ILC3, increased the ability of the CYP3A11-metabolized drug glyburide to decrease blood glucose levels when given orally. In mouse SI enteroid cultures, IL-22 dose-dependently reduced the expression of Cyp3a11 and decreased the ability of enteroids to metabolize CYP3A11-specific substrates. Finally, IL-22 induced wide changes in the transcriptome of human SI enteroids, with substantial effects on a drug metabolism pathway centred around CYP3A. Conclusions Our data suggest that a gut-resident microbe (SFB) can influence the expression and activity of the drug metabolising enzyme CYP3A11 in the SI through an ILC3-IL-22 dependent mechanism. These findings provide an understanding of how the intestinal microbiota may modulate host drug metabolism to influence the efficacy and toxicity of various pharmaceutical compounds. Funding Agencies CAG, CIHRAbbvie, Lloyd Sutherland Investigatorship

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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