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Enregistrement W3008397582 · doi:10.1186/s12866-020-1705-2

An operon consisting of a P-type ATPase gene and a transcriptional regulator gene responsible for cadmium resistances in Bacillus vietamensis 151–6 and Bacillus marisflavi 151–25

2020· article· en· W3008397582 sur OpenAlex
Xiaoxia Yu, Zundan Ding, Yangyang Ji, Jintong Zhao, Xiaoqing Liu, Jian Tian, Ningfeng Wu, Yunliu Fan

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueChromium effects and bioremediation
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyOperonMicrobiologyEffluxCadmiumGeneBacillus (shape)Gene clusterTranscriptomeBacteriaGene expressionEscherichia coliGeneticsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Cadmium (Cd) is a severely toxic heavy metal to most microorganisms. Many bacteria have developed Cd 2+ resistance. Results In this study, we isolated two different Cd 2+ resistance Bacillus sp . strains, Bacillus vietamensis 151–6 and Bacillus marisflavi 151–25, which could be grown in the presence of Cd 2+ at concentration up to 0.3 mM and 0.8 mM, respectively. According to the genomic sequencing, transcriptome analysis under cadmium stress, and other related experiments, a gene cluster in plasmid p25 was found to be a major contributor to Cd 2+ resistance in B. marisflavi 151–25. The cluster in p25 contained orf4802 and orf4803 which encodes an ATPase transporter and a transcriptional regulator protein, respectively. Although 151–6 has much lower Cd 2+ resistance than 151–25, they contained similar gene cluster, but in different locations. A gene cluster on the chromosome containing orf4111 , orf4112 and orf4113 , which encodes an ATPase transporter, a cadmium efflux system accessory protein and a cadmium resistance protein, respectively, was found to play a major role on the Cd 2+ resistance for B. vietamensis 151–6. Conclusions This work described cadmium resistance mechanisms in newly isolated Bacillus vietamensis 151–6 and Bacillus marisflavi 151–25. Based on homologies to the cad system (CadA-CadC) in Staphylococcus aureus and analysis of transcriptome under Cd 2+ induction, we inferred that the mechanisms of cadmium resistance in B. marisflavi 151–25 was as same as the cad system in S. aureus . Although Bacillus vietamensis 151–6 also had the similar gene cluster to B. marisflavi 151–25 and S. aureus , its transcriptional regulatory mechanism of cadmium resistance was not same. This study explored the cadmium resistance mechanism for B. vietamensis 151–6 and B. marisflavi 151–25 and has expanded our understanding of the biological effects of cadmium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,389
Score d'incertitude au seuil0,547

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle