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Enregistrement W3008614307 · doi:10.1101/2020.02.19.953034

Oxidative Modifications of Parkin Underlie its Selective Neuroprotection in Adult Human Brain

2020· preprint· en· W3008614307 sur OpenAlexaff
Jacqueline M. Tokarew, Daniel N. El-Kodsi, Nathalie A. Lengacher, Travis K. Fehr, Angela Nguyen, Brian O’Nuallain, Ming Jin, Jasmine M. Khan, Andy Cheuk‐Him Ng, Juan Li, Qiubo Jiang, Mei Zhang, Liqun Wang, Rajib Sengupta, Kathryn R. Barber, An Tran, Stéphanie Zandee, Xiajun Dong, Clemens R. Scherzer, Alexandre Prat, Eve C. Tsai, Masashi Takanashi, Nobutaka Hattori, Jennifer A. Chan, Andrew B. West, Arne Holmgren, Lawrence G. Puente, Gary S. Shaw, Gergely Tóth, John Woulfe, Peggy Taylor, Julianna J. Tomlinson, Michael G. Schlossmacher

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversité de MontréalWestern UniversityOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParkinNeuroprotectionNeuromelaninDopamineSubstantia nigraChemistryBiochemistryBiologyParkinson's diseaseNeuroscienceDopaminergicInternal medicineMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY The mechanisms by which Parkinson disease-linked parkin confers neuroprotection of human dopamine cells remain elusive. We hypothesized that its cysteines mediate multiple anti-oxidant effects in the midbrain. By studying >60 control specimens, we found that in adult human brain - but not in skeletal muscle- parkin is mostly aggregated and insoluble due to oxidative modifications, such as at C253. In vitro , parkin’s oxidation directly reduces hydrogen peroxide (H 2 O 2 ) to water. In parkin-deficient human brain, H 2 O 2 concentrations are elevated. In dopamine toxicity studies, wild-type parkin -but not disease-associated mutants-prevents neural death by lowering H 2 O 2 and sequestering radicals within insoluble aggregates. Parkin conjugates dopamine metabolites at the human-specific residue C95 and augments melanin formation in vitro . Using epitope-mapped antibodies, we found that in adult Substantia nigra neurons parkin localizes to neuromelanin within LAMP-3/CD63-positive lysosomes. We conclude that parkin’s own oxidation, previously considered a loss-of-function event, underlies three neuroprotective effects in adult midbrain: its cysteines participate in H 2 O 2 reduction, dopamine radical conjugation and the formation of neuromelanin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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