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Enregistrement W3009262414 · doi:10.1101/2020.02.22.20026757

Polygenic modulation of lipoprotein(a)-associated cardiovascular risk

2020· preprint· en· W3009262414 sur OpenAlexafffund
Mark Trinder, Liam R. Brunham

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMichael Smith Health Research BCCompute CanadaProvidence Health Care
Mots-clésLipoprotein(a)Myocardial infarctionInternal medicineMedicinePercentileLipoproteinCoronary artery diseaseHazard ratioCardiologyEndocrinologyCholesterolConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Aims Elevated levels of lipoprotein(a) are one of the strongest inherited risk factors for coronary artery disease (CAD). However, there is variability in cardiovascular risk among individuals with elevated lipoprotein(a). The sources of this variability are incompletely understood. We assessed the effects of a genomic risk score (GRS) for CAD on risk of myocardial infarction among individuals with elevated lipoprotein(a). Methods We calculated CAD GRSs for 408,896 individuals of British white ancestry from the UK Biobank using 6.27 million common genetic variants. Lipoprotein(a) levels were measured in 310,020 individuals. The prevalence and risk of myocardial infarction versus CAD GRS percentiles were compared for individuals with and without elevated lipoprotein(a) defined as ≥120 or 168 nmol/L (≈50 or 70 mg/dL, respectively). Results Individuals with elevated lipoprotein(a) displayed significantly greater CAD GRSs than individuals without elevated lipoprotein(a), which was largely dependent on the influence of genetic variants within or near the LPA gene. Continuous levels of CAD GRS percentile were significantly associated with risk of myocardial infarction for individuals with elevated lipoprotein(a). Notably, the risk of myocardial infarction for males with elevated lipoprotein(a) levels, but a CAD GRS percentile in the lower quintile (<20 th percentile), was less than the overall risk of myocardial infarction for males with non-elevated lipoprotein(a) levels (hazard ratio [95% CI]: 0.79 [0.64-0.97], p=0.02). Similar results were observed for females. Conclusion These data suggest that CAD genomic scores influence cardiovascular risk among individuals with elevated lipoprotein(a) and may aid in identifying candidates for preventive therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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