Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
RevueGenetic Epidemiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversité LavalBC Cancer AgencyCentre hospitalier universitaire de QuébecMcGill UniversityUniversity Health NetworkUniversity of TorontoRoyal Victoria HospitalQueen's UniversityLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandFogarty International CenterNational Institute of General Medical SciencesNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingServicio Gallego de SaludInstituto de Salud Carlos IIICancer Council Western AustraliaCancer Council NSWCancer Council VictoriaWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilHellenic Health FoundationFreistaat SachsenInstitut Català de la SalutCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerBiomedical Research CouncilFederal Agency for Scientific OrganizationsMutuelle Générale de l'Education NationaleInstitut Gustave-RoussyMinistero dello Sviluppo EconomicoRadboud Universitair Medisch CentrumNational Health and Medical Research CouncilMinistry of Education, Science and TechnologyAcademia SinicaDeutsche KrebshilfeCancer Institute NSWMedizinischen Hochschule HannoverCancer Council South AustraliaCentre International de Recherche sur le CancerKreftforeningenInstitut National Du CancerOak FoundationLeids Universitair Medisch CentrumKarolinska InstitutetAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroKWF KankerbestrijdingVetenskapsrådetFondation de FranceStavros Niarchos FoundationUniversity of WestminsterLigue Contre le CancerKorea Health Industry Development InstituteHungarian Scientific Research FundMinisterio de Economía y CompetitividadErasmus Medisch CentrumJapan Agency for Medical Research and DevelopmentDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekKing's College LondonFondation ARC pour la Recherche sur le CancerGentofte HospitalCalifornia Breast Cancer Research ProgramGeneralitat de CatalunyaAlexander von Humboldt-StiftungCancerfondenAmerican Cancer SocietyCancer AustraliaRadboud UniversiteitRussian Foundation for Basic ResearchKuopion Yliopistollinen SairaalaNational Medical Research CouncilNorges ForskningsrådStockholms Läns LandstingUniversiteit MaastrichtVrije Universiteit AmsterdamAcademy of FinlandMaastricht Universitair Medisch CentrumNational Heart, Lung, and Blood InstituteOhio State UniversityUniversiteit LeidenUniversity of CreteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgency for Science, Technology and ResearchCanadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionAvon Foundation for WomenBreast Cancer Research TrustFondation du cancer du sein du QuébecNational Cancer InstituteEuropean Regional Development FundMinisterio de Sanidad, Servicios Sociales e IgualdadUniversity of CambridgeNemzeti Kutatási Fejlesztési és Innovációs HivatalVirginia Department of HealthGovernment of CanadaGeorgetown UniversityBreast Cancer CampaignNational Research FoundationNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchNational Breast Cancer FoundationAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailNational Institute of Environmental Health SciencesSwedish Cancer FoundationLon V. Smith FoundationFundación Mutua MadrileñaMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationInstitute of Biomedical Sciences, Academia SinicaDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådDeutsches KrebsforschungszentrumUniversity College LondonNational Research Foundation of KoreaCalifornia Department of Public HealthGenome CanadaCancer Council TasmaniaItä-Suomen YliopistoProgramme Grants for Applied ResearchRobert Bosch StiftungCenter for Agroforestry, University of MissouriOulun YliopistoFundación CellexFisher Center for Alzheimer's Research FoundationCenters for Disease Control and PreventionNational Institute for Health and Care ResearchSusan G. Komen for the CureTaiwan BiobankU.S. Department of Health and Human ServicesAgence Nationale de la RechercheU.S. ArmyLandspítali HáskólasjúkrahúsNational Center for Advancing Translational SciencesBundesministerium für Bildung und ForschungMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyOvarian Cancer Research FundNational Institutes of HealthDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteCancer Research UKBreast Cancer Research FoundationRijksuniversiteit GroningenDeutscher Akademischer AustauschdienstYayasan Sime DarbyXunta de GaliciaDr. Ralph and Marian Falk Medical Research TrustFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésBreast cancerGenome-wide association studyEstrogen receptorTranscriptomeBiologyGenetic associationOncologyGeneCancerEstrogen receptor alphaGeneticsComputational biologyMedicineSingle-nucleotide polymorphismGene expressionGenotype
Résumé
récupéré en direct d'OpenAlexPrevious transcriptome-wide association studies (TWAS) have identified breast cancer risk genes by integrating data from expression quantitative loci and genome-wide association studies (GWAS), but analyses of breast cancer subtype-specific associations have been limited. In this study, we conducted a TWAS using gene expression data from GTEx and summary statistics from the hitherto largest GWAS meta-analysis conducted for breast cancer overall, and by estrogen receptor subtypes (ER+ and ER-). We further compared associations with ER+ and ER- subtypes, using a case-only TWAS approach. We also conducted multigene conditional analyses in regions with multiple TWAS associations. Two genes, STXBP4 and HIST2H2BA, were specifically associated with ER+ but not with ER- breast cancer. We further identified 30 TWAS-significant genes associated with overall breast cancer risk, including four that were not identified in previous studies. Conditional analyses identified single independent breast-cancer gene in three of six regions harboring multiple TWAS-significant genes. Our study provides new information on breast cancer genetics and biology, particularly about genomic differences between ER+ and ER- breast cancer.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
