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Enregistrement W3010925428 · doi:10.1530/rep-19-0436

FANCD2 is required for the repression of germline transposable elements

2020· article· en· W3010925428 sur OpenAlexfundno aff
Yan Nie, Andrew F. Wilson, Tony DeFalco, Amom Ruhikanta Meetei, Satoshi H. Namekawa, Qishen Pang

Notice bibliographique

RevueReproduction · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthUniversité Laval
Mots-clésFANCD2BiologyPsychological repressionCell biologyFANCAPiwi-interacting RNAGerm cellDNA damageFanconi anemiaGermlineDNA repairGeneticsTransposable elementDNAGeneMutantGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fanconi anemia (FA) is a genetic disease associated with bone marrow failure, increased cancer, and severe germline defects, and the FA pathway is known to play a major role in the DNA damage response (DDR) network (Bagby 2003, 2018, Tischkowitz & Hodgson 2003). FA is genetically heterogeneous, with at least 22 complementation groups (FANCA-FANCW) identified thus far (Dong et al. 2015, Sawyer et al. 2015, Knies et al. 2017). Eight of the FA proteins (FANCA, B, C, E, F, G, L, and M) form the FA core complex that functions as an ubiquitin ligase. In response to DNA damage or DNA replication stress, the FA core complex monoubiquitinates two downstream FA proteins, FANCD2 and FANCI, which then recruit the downstream FA proteins and other DNA repair factors, to nuclear loci containing damaged DNA and consequently influence important cellular processes such as DNA replication, cell-cycle control, and DNA damage response and repair (Deans & West 2011, Kottemann & Smogorzewska 2013).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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