Organization And Introgression Mechanics Of Phaseolus Vulgaris (Common Bean)
Notice bibliographique
Résumé
Phaseolus vulgaris is a major food crop grown and consumed around the world. A new world vegetable, the common bean underwent two separate domestication events, both pre-Columbus. These events generated two different land races, the Mesoamerican and Andean, named for the area where the domestication took place. Since the initial domestications the land races have been generally evenly cultivated, but despite its popularity the common bean has only very recently been fully sequenced. One of the issues faced by bean growers worldwide is Common Bacterial Blight (CBB). A disease caused by Xanthomonas axonopodis, CBB causes crop loses ranging from 20–40% every year but does not affect all species within Phaseolus evenly; P. acutifolius, for example, shows an innate resistance to CBB. To leverage this advantage, researchers at the University of Guelph, in partnership with the Ontario Agricultural College, developed a cultivar of Mesoamerican P. vulgaris that was introgressed with PI440795, a P. acutifolius accession, and backcrossed repeatedly with several other Mesoamerican P. vulgaris accessions to generate ‘OAC-Rex’, a plant that displays the crop-desired traits of P. vulgaris and the disease resistance traits of P. acutifolius. Genetic introgression is the process of crossing distantly related organisms followed by repeated backcrossing, resulting in a viable offspring that displays characteristics of each parent. Though rarely occurring, it can be observed in both plants and animals and is often exploited in a crop development context to generate new cultivars. Unfortunately, though regularly observed, introgression has been followed on a predominantly phenotypic level, usually many generations after the event, and as such molecular aspects of this phenomenon are largely unknown.By studying OAC-Rex, PI440795, and G-19833 (an Andean cultivar whose whole-genome has been published) introgression was examined directly and a method for the detection of regions within the introgressed genome uniquely donated from either parent
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».