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Enregistrement W3011576831 · doi:10.1038/s41587-020-0477-4

Publisher Correction: MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing

2020· article· en· W3011576831 sur OpenAlexaff
Christian Lieven, Moritz E. Beber, Brett G. Olivier, Frank Bergmann, Meriç Ataman, Parizad Babaei, Jennifer Bartell, Lars M. Blank, Siddharth Chauhan, Kevin Correia, Christian Diener, Andreas Dräger, Birgitta E. Ebert, Janaka N. Edirisinghe, José P. Faria, Adam M. Feist, Georgios Fengos, Ronan M. T. Fleming, Beatriz García-Jiménez, Vassily Hatzimanikatis, Wout van Helvoirt, Christopher S. Henry, Henning Hermjakob, Markus J. Herrgård, Ali Kaafarani, Hyun Uk Kim, Zachary A. King, Steffen Klamt, Edda Klipp, Jasper J. Koehorst, Matthias König, Meiyappan Lakshmanan, Dong‐Yup Lee, Sang Yup Lee, Sunjae Lee, Nathan E. Lewis, Filipe Liu, Hongwu Ma, Daniel Machado, Radhakrishnan Mahadevan, Paulo Maia, Adil Mardinoğlu, Gregory L. Medlock, Jonathan M. Monk, Jens Nielsen, Lars K. Nielsen, Juan Nogales, Intawat Nookaew, Bernhard Ø. Palsson, Jason A. Papin, Kiran Raosaheb Patil, Mark G. Poolman, Nathan D. Price, Osbaldo Reséndis-Antonio, Anne Richelle, Isabel Rocha, Benjamín J. Sánchez, Peter J. Schaap, Rahuman S. Malik‐Sheriff, Saeed Shoaie, Nikolaus Sonnenschein, Bas Teusink, Paulo Vilaça, Jon Olav Vik, Judith A. H. Wodke, Joana C. Xavier, Qianqian Yuan, Maksim Zakhartsev, Cheng Zhang

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNovo Nordisk Fonden
Mots-clésComputational biologyScale (ratio)Computer scienceBiologyGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

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Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,561
Score d'incertitude au seuil0,856

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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