MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3011604184 · doi:10.3389/fmicb.2020.00411

New Insights Into Acidithiobacillus thiooxidans Sulfur Metabolism Through Coupled Gene Expression, Solution Chemistry, Microscopy, and Spectroscopy Analyses

2020· article· en· W3011604184 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMetal Extraction and Bioleaching
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de MontréalOntario GenomicsPolytechnique MontréalGenome Canada
Mots-clésRhodaneseSulfur metabolismAcidithiobacillus thiooxidansSulfurChemistryBiochemistryTetrathionateIntracellularThiosulfateSulfideMetabolismEnzymeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Here, we experimentally expand understanding of the reactions and enzymes involved in A. thiooxidans ATCC 19377 S0 and S2O32- metabolism by developing models that integrate gene expression analyzed by RNA-Seq, solution sulfur speciation, electron microscopy and spectroscopy. The A. thiooxidans S2O32- metabolism model involves the conversion of S2O32- to SO42-, S0 and S4O62-, mediated by the sulfur oxidase complex (Sox), tetrathionate hydrolase (TetH), sulfide quinone reductase (Sqr) and heterodisulfate reductase (Hdr) proteins. These same proteins, with the addition of rhodanese (Rhd), were identified to convert S0 to SO32-, S2O32- and polythionates in the A. thiooxidans S0 metabolism model. Our combined results shed light onto the important role specifically of TetH in S2O32- metabolism. Also, we show that activity of Hdr proteins rather than Sdo are likely associated with S0 oxidation. Finally, our data suggest that formation of intracellular S2O32- is a critical step in S0 metabolism, and that recycling of internally generated SO32- occurs, through comproportionating reactions that result in S2O32-. Electron microscopy and spectroscopy confirmed intracellular production and storage of S0 during growth on both S0 and S2O32- substrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,206
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle