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Enregistrement W3012628895 · doi:10.1186/s13568-020-00971-2

Decreased expression of LRA4, a key gene involved in rhamnose metabolism, caused up-regulated expression of the genes in this pathway and autophagy in Pichia pastoris

2020· article· en· W3012628895 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAMB Express · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesCentral Public-interest Scientific Institution Basal Research Fund, Chinese Academy of Fishery SciencesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAutophagyPichia pastorisGeneGene expressionCell biologyBiologyBiochemistryRecombinant DNAApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In a previous study, we developed Pichia pastoris GS115m, an engineered strain with decreased expression of one key gene, LRA4 , in rhamnose metabolism. P. pastoris GS115m/ LacB was subsequently constructed via introducing a β-galactosidase gene, LacB , under the control of rhamnose-inducible P LRA3 into P. pastoris GS115m. P. pastoris GS115m/ LacB greatly improved recombinant protein production relative to the parental strain ( P . pastoris GS115/ LacB ). In the present study, transcriptomes of P . pastoris GS115m/ LacB and P . pastoris GS115/ LacB grown in YPR medium were analyzed. P . pastoris GS115m/ LacB was found to suffer from the mild carbon source starvation. To attenuate the starvation stress, P . pastoris GS115m/ LacB attempted to enhance rhamnose metabolism by elevating the transcription levels of rhamnose-utilization genes LRA1 - 3 and RhaR . The transcription level of LacB under the control of P LRA3 thereby increased, resulting in the improved production of recombinant protein in P . pastoris GS115m/ LacB . It was also revealed that P . pastoris GS115m/ LacB cells coped with carbon starvation mostly via autophagy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,790

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle