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Enregistrement W3012962773 · doi:10.1101/2020.03.23.20041467

Novel manifestations of immune dysregulation and granule defects in gray platelet syndrome

2020· preprint· en· W3012962773 sur OpenAlexaff
Matthew C. Sims, Louisa Mayer, Janine Collins, Tadbir K. Bariana, Karyn Mégy, Cécile Lavenu‐Bombled, Denis Seyres, Laxmikanth Kollipara, Frances Burden, Daniel Greene, Dave Lee, Antonio Rodriguez-Romera, Marie‐Christine Alessi, William J. Astle, Wadie F. Bahou, Loredana Bury, Elizabeth Chalmers, Rachael Da Silva, Erica De Candia, Sri V. V. Deevi, Samantha Farrow, Keith Gomez, Luigi Grassi, Andreas Greinacher, Paolo Gresele, Dan Hart, M.-F. Hurtaud, Anne M. Kelly, Ron Kerr, Sandra Le Quellec, Thierry Leblanc, Eva Leinøe, Rutendo Mapeta, Harriet McKinney, Alan D. Michelson, Sara Moráis, Diane J. Nugent, Sofia Papadia, Soo Jung Park, John Pasi, Gian Marco Podda, Man‐Chiu Poon, Rachel Reed, Mallika Sekhar, Hanna Shalev, Suthesh Sivapalaratnam, Orna Steinberg‐Shemer, Jonathan Stephens, Robert C. Tait, Ernest Turro, John K. Wu, Barbara Zieger, Taco W. Kuijpers, Anthony D. Whetton, Albert Sickmann, Kathleen Freson, Kate Downes, Wendy N. Erber, Mattia Frontini, Paquita Nurden, Willem H. Ouwehand, Rémi Favier, José A. Guerrero

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia HospitalUniversity of CalgaryUniversity of British ColumbiaDiscovery Centre
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFondazione Umberto VeronesiCambridge University HospitalsDeutsche ForschungsgemeinschaftRosetrees TrustScience and Technology Facilities CouncilBritish Heart FoundationUniversity College LondonBritish Society for HaematologyNational Institute for Health and Care ResearchIsaac Newton TrustDell EMCNHS Blood and TransplantNIHR BioResourceSwedish Orphan BiovitrumUniversity of CambridgeCancer Research UKWellcome TrustDepartment of Health and Social CareEngineering and Physical Sciences Research CouncilCSL Behring
Mots-clésImmune systemImmunologyImmune dysregulationPlateletPhenotypeTranscriptomeBiologyInflammationFibrosisHaematopoiesisMedicinePathologyStem cellCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Gray platelet syndrome (GPS) is a rare recessive disorder caused by variants in NBEAL2 and characterized by bleeding symptoms, the absence of platelet ɑ-granules, splenomegaly and bone marrow (BM) fibrosis. Due to its rarity, it has been difficult to fully understand the pathogenic processes that lead to these clinical sequelae. To discern the spectrum of pathological features, we performed a detailed clinical genotypic and phenotypic study of 47 GPS patients. We identified 33 new causal variants in NBEAL2 . Our GPS patient cohort exhibited known phenotypes, including macro-thrombocytopenia, BM fibrosis, megakaryocyte emperipolesis of neutrophils, splenomegaly, and elevated serum vitamin B12 levels. We also observed novel clinical phenotypes; these include reduced leukocyte counts and increased presence of autoimmune disease and positive autoantibodies. There were widespread differences in the transcriptome and proteome of GPS platelets, neutrophils, monocytes, and CD4-lymphocytes. Proteins less abundant in these cells were enriched for constituents of granules, supporting a role for Nbeal2 in the function of these organelles across a wide range of blood cells. Proteomic analysis of GPS plasma showed increased levels of proteins associated with inflammation and immune response. One quarter of plasma proteins increased in GPS are known to be synthesized outside of hematopoietic cells, predominantly in the liver. In summary, our data demonstrate that, in addition to the well-described platelet defects in GPS, there are also immune defects. The abnormal immune cells may be the drivers of systemic abnormalities, such as autoimmune disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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