MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3013386813 · doi:10.1128/jb.00762-19

Genetic Analysis of Mutacin B-Ny266, a Lantibiotic Active against Caries Pathogens

2020· article· en· W3013386813 sur OpenAlexafffund
Delphine Dufour, Abdelahhad Barbour, Yuki Chan, Taimoor Rahman, Matthew Thorburn, Cameron A. Stewart, Yoav Finer, Siew‐Ging Gong, Céline M. Lévesque

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésBacteriocinBiologyLantibioticsStreptococcus mutansOperonStreptococcus sobrinusLocus (genetics)Antimicrobial peptidesMicrobiologySerineGeneticsPeptideBiochemistryBacteriaGeneEscherichia coliPhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although dental caries is largely preventable, it remains the most common and costly infectious disease worldwide. Caries is initiated by the presence of dental plaque biofilm that contains Streptococcus mutans , a species extensively characterized by its role in caries development and formation. S. mutans deploys an arsenal of strategies to establish itself within the oral cavity. One of them is the production of bacteriocins that confer a competitive advantage by targeting and killing closely related competitors. In this work, we found that mutacin B-Ny266 is a potent lantibiotic that is effective at killing a wide array of oral streptococci, including nearly all S. mutans strains tested. Lantibiotics produced by oral bacteria could represent a promising strategy to target caries pathogens embedded in dental plaque biofilm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of BacteriologyMême sujetOral microbiology and periodontitis researchTravaux en français237 207