MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3014176044 · doi:10.1186/s12985-020-01304-2

The USP18 cysteine protease promotes HBV production independent of its protease activity

2020· article· en· W3014176044 sur OpenAlexaff
Yujia Li, Xiaoqiong Duan, Haiyan Ye, Shilin Li, Limin Chen, Chunhui Yang, Yongjun Chen

Notice bibliographique

RevueVirology Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesChinese Academy of Medical Sciences Initiative for Innovative MedicineDepartment of Science and Technology of Sichuan ProvinceMassachusetts General Hospital
Mots-clésBiologyProteaseVirologyCysteine proteaseMicrobiologyEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hepatitis B virus (HBV) infection remains as one of the major public health problems in the world. Type I interferon (IFN) plays an essential role in antiviral defense by induced expression of a few hundred interferon stimulated genes (ISGs), including ubiquitin-specific protease 18 (USP18). The expression level of USP18 was elevated in the pretreatment liver tissues of chronic hepatitis B(CHB) patients who did not respond to IFN treatment. Thus, this study was designed to investigate the effects of USP18 on HBV replication/production. METHODS: The levels of wild type USP18(WT-USP18) and USP18 catalytically inactive form C64S were up-regulated by plasmids transfection in HepAD38 cells, respectively. Real-time PCR and ELISA were used to quantify HBV replication. Type I IFN signaling pathway was monitored at three levels: p-STAT1 (western Blot), interferon stimulated response element (ISRE) activity (dual luciferase assay) and ISGs expression (real time PCR). RESULTS: Our data demonstrated that overexpression of either WT-USP18 or USP18-C64S inactive mutant increased the intracellular viral pgRNA, total DNA, cccDNA, as well as HBV DNA levels in the culture supernatant, while silencing USP18 led to opposite effect on HBV production. In addition, upregulated WT-USP18 or USP18-C64S suppressed ISRE activity and the expression levels of p-STAT1 and ISGs. CONCLUSION: USP18 promoted HBV replication via inhibiting type I IFN signaling pathway, which was independent of its protease activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,391
Score d'incertitude au seuil0,443

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueVirology JournalMême sujetHepatitis B Virus StudiesTravaux en français237 207