O16.4 Structural similarity of<i>treponema pallidum</i>protein Tp0225 with human toll-like receptor 2
Notice bibliographique
Résumé
Background The causative agent of syphilis, Treponema pallidum, is a highly invasive chronic pathogen. Here we used bioinformatics and structural biology to characterize the sole LRR-containing protein in T. pallidum, Tp0225. In other bacterial pathogens, Leucine-Rich Repeat (LRR)-containing proteins contribute to chronicity by mediating attachment, invasion and immune evasion. Methods A phylogenetic tree was constructed to determine the evolutionary relationship between Tp0225 and LRR homologs from pathogenic and non-pathogenic treponemes. The size and organization of Tp0225 protein domains were analyzed by comparing them to the domains of the treponemal homologs. For structure determination, the full-length recombinant protein was purified, crystallized, and the three dimensional structure determined using X-ray crystallography. Results Bioinformatic analyses showed that Tp0225 has diverged more from non-pathogens compared to pathogens during evolution. The structure of Tp0225 demonstrated that the protein adopts a non-classical LRR fold and contains a hydrophobic pocket on the surface of the structure. This unusual LRR characteristic is similar to the hydrophobic pocket found on the surface of the human Toll-like Receptor 2 (TLR2) LRR domain that recognizes T. pallidum during infection. Conclusion We have determined the structure of the only LRR-containing protein in T. pallidum and have shown that it contains an unusual LRR structural feature that is shared with the host innate immune signaling molecule TLR2. This structural mimicry may be involved in subversion of normal host processes during T. pallidum infection. Disclosure No significant relationships.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».