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Enregistrement W3014294147 · doi:10.1136/sextrans-2019-sti.196

O16.4 Structural similarity of<i>treponema pallidum</i>protein Tp0225 with human toll-like receptor 2

2019· article· en· W3014294147 sur OpenAlex
Simon Houston, Raghavendran Ramaswamy, Bianca C. Loveless, Martin J. Boulanger, Caroline E. Cameron

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOral Presentations · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSyphilis Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTreponemaLeucine-rich repeatNeisseriaInnate immune systemBiologyTLR2Bacterial adhesinProtein structurePathogenGeneticsGeneComputational biologySyphilisReceptorVirologyBacteriaVirulenceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Background</h3> The causative agent of syphilis, <i>Treponema pallidum</i>, is a highly invasive chronic pathogen. Here we used bioinformatics and structural biology to characterize the sole LRR-containing protein in <i>T. pallidum</i>, Tp0225. In other bacterial pathogens, Leucine-Rich Repeat (LRR)-containing proteins contribute to chronicity by mediating attachment, invasion and immune evasion. <h3>Methods</h3> A phylogenetic tree was constructed to determine the evolutionary relationship between Tp0225 and LRR homologs from pathogenic and non-pathogenic treponemes. The size and organization of Tp0225 protein domains were analyzed by comparing them to the domains of the treponemal homologs. For structure determination, the full-length recombinant protein was purified, crystallized, and the three dimensional structure determined using X-ray crystallography. <h3>Results</h3> Bioinformatic analyses showed that Tp0225 has diverged more from non-pathogens compared to pathogens during evolution. The structure of Tp0225 demonstrated that the protein adopts a non-classical LRR fold and contains a hydrophobic pocket on the surface of the structure. This unusual LRR characteristic is similar to the hydrophobic pocket found on the surface of the human Toll-like Receptor 2 (TLR2) LRR domain that recognizes <i>T. pallidum</i> during infection. <h3>Conclusion</h3> We have determined the structure of the only LRR-containing protein in <i>T. pallidum</i> and have shown that it contains an unusual LRR structural feature that is shared with the host innate immune signaling molecule TLR2. This structural mimicry may be involved in subversion of normal host processes during <i>T. pallidum</i> infection. <h3>Disclosure</h3> No significant relationships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle