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Enregistrement W3015000841 · doi:10.1002/csc2.20157

Mapping genomic regions controlling agronomic traits in spring wheat under conventional and organic managements

2020· article· en· W3015000841 sur OpenAlexafffundabout
Hua Chen, Darcy H. Bemister, Muhammad Iqbal, Stephen E. Strelkov, Dean Spaner

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta Wheat CommissionWestern Grains Research FoundationAgriculture and Agri-Food CanadaAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyAgronomyTraitMarker-assisted selectionGlutenBiotechnologyGeneticsGeneFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Identification of quantitative trait loci (QTL) associated with important traits is one of the first steps towards deploying marker‐assisted selection, but the lack of stability and consistency in identifying QTL across environments and populations remains a limitation. We conducted this study to identify QTL associated with agronomic traits in wheat ( Triticum aestivum L.) across management‐specific environments. A total of 204 wheat lines derived from the ‘Peace’ × ‘Carberry’ cross were evaluated in 2016 and 2017 under conventional and organic managements in Edmonton, Canada, and genotyped with diversity arrays technology markers. Using the least‐squares means for each management system, 53 QTL were identified for nine agronomic traits, 14 of which were consistently identified in both managements. The largest QTL we identified was associated with plant height ( QPht.dms‐4B ), which might be the plant height‐reducing gene Rht‐B1b from ‘Carberry’. It explained 54 and 49% of the phenotypic variation in conventional and organic management, respectively. The second largest QTL was associated with gluten strength ( QSds.dms‐1A ) in both managements. We identified consistent QTL across both organic and conventional managements, even though they were generally minor‐effect QTL. Twelve organic management‐specific QTL were found for grain yield, days to heading and maturity, plant height, test weight, and thousand‐kernel weight, but most explained relatively low amount of phenotypic variation. The QTL identified across managements, especially the gluten strength QTL ( QSds.dms‐1A ), may serve as useful markers in selection. The QSds.dms‐1A region needs to be investigated further to confirm whether it is the Gli‐1 storage protein gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,986
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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