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Enregistrement W3015256595 · doi:10.1371/journal.pgen.1008733

Loss of Cdc13 causes genome instability by a deficiency in replication-dependent telomere capping

2020· article· en· W3015256595 sur OpenAlexafffund
Rachel E. Langston, Dominic Palazzola, Erin Bonnell, Raymund J. Wellinger, Ted Weinert

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyTelomereHomologous chromosomeChromosomeHomologous recombinationChromosome instabilityDNA replicationGenome instabilityGeneticsTelomere-binding proteinDNAGenomeChromosome segregationMolecular biologyDNA-binding proteinGeneDNA damage

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In budding yeast, Cdc13, Stn1, and Ten1 form the telomere-binding heterotrimer CST complex. Here we investigate the role of Cdc13/CST in maintaining genome stability by using a Chr VII disome system that can generate recombinants, chromosome loss, and enigmatic unstable chromosomes. In cells expressing a temperature sensitive CDC13 allele, cdc13F684S, unstable chromosomes frequently arise from problems in or near a telomere. We found that, when Cdc13 is defective, passage through S phase causes Exo1-dependent ssDNA and unstable chromosomes that are then the source for additional chromosome instability events (e.g. recombinants, chromosome truncations, dicentrics, and/or chromosome loss). We observed that genome instability arises from a defect in Cdc13's function during DNA replication, not Cdc13's putative post-replication telomere capping function. The molecular nature of the initial unstable chromosomes formed by a Cdc13-defect involves ssDNA and does not involve homologous recombination nor non-homologous end joining; we speculate the original unstable chromosome may be a one-ended double strand break. This system defines a link between Cdc13's function during DNA replication and genome stability in the form of unstable chromosomes, that then progress to form other chromosome changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,633

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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