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Enregistrement W3015616260 · doi:10.3389/fcimb.2020.00154

Trypanosoma brucei and Trypanosoma cruzi DNA Mismatch Repair Proteins Act Differently in the Response to DNA Damage Caused by Oxidative Stress

2020· article· en· W3015616260 sur OpenAlexfundno aff
Viviane Grazielle-Silva, Richard Burchmore, Carlos Renato Machado, Richard McCulloch, Santuza Maria Ribeiro Teixeira

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesUniversidade Federal de Minas GeraisFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorWellcome TrustMcGill University
Mots-clésTrypanosoma cruziTrypanosoma bruceiDNA damageOxidative stressDNABiologyDNA repairVirologyGeneticsGeneBiochemistryParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MSH2, associated with MSH3 or MSH6, is a central component of the eukaryotic DNA Mismatch Repair (MMR) pathway responsible for the recognition and correction of base mismatches that occur during DNA replication and recombination. Previous studies have shown that MSH2 plays an additional DNA repair role in response to oxidative damage in Trypanosoma cruzi and Trypanosoma brucei. By performing co-immunoprecipitation followed by mass spectrometry with parasites expressing tagged proteins, we confirmed that the parasites’ MSH2 forms complexes with MSH3 and MSH6. To investigate the involvement of these two other MMR components in the oxidative stress response, we generated knockout mutants of MSH6 and MSH3 in T. brucei bloodstream forms and MSH6 mutants in T. cruzi epimastigotes. Differently from the phenotype observed with T. cruzi MSH2 knockout epimastigotes, loss of one or two alleles of T. cruzi msh6 resulted in increased susceptibility to H2O2 exposure, besides impaired MMR. In contrast, T. brucei msh6 or msh3 null mutants displayed increased tolerance to MNNG treatment, indicating that MMR is affected, but no difference in the response to H2O2 treatment when compared to wild type cells. Taken together, our results suggest that, while T. cruzi MSH6 and MSH2 are involved with the oxidative stress response in addition to their role as components of the MMR, the DNA repair pathway that deals with oxidative stress damage operates differently in T. brucei.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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