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Enregistrement W3016154560 · doi:10.1101/2020.04.10.20059121

ACE inhibition and cardiometabolic risk factors, lung <i>ACE2</i> and <i>TMPRSS2</i> gene expression, and plasma ACE2 levels: a Mendelian randomization study

2020· preprint· en· W3016154560 sur OpenAlexaff
Dipender Gill, Marios Arvanitis, Paul Carter, Ana I. Hernández Cordero, Brian Jo, Ville Karhunen, Susanna C. Larsson, Xuan Li, Sam Lockhart, Amy M. Mason, Evanthia Pashos, Ashis Saha, Vanessa Y. Tan, Verena Zuber, Yohan Bossé, Sarah Fahle, Ke Hao, Tao Jiang, Philippe Joubert, Alan Lunt, Willem H. Ouwehand, David J. Roberts, Wim Timens, Maarten van den Berge, Nicholas A. Watkins, Alexis Battle, Adam S. Butterworth, John Danesh, Barbara E. Engelhardt, James E. Peters, Don D. Sin, Stephen Burgess

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenin-Angiotensin System Studies
Établissements canadiensInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversité LavalSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNIHR BioResourceUniversity of CambridgeNational Institute for Health and Care ResearchBritish Heart FoundationWellcome TrustNHS Blood and TransplantMedical Research CouncilBiogenPrinceton UniversityNIHR Cambridge Biomedical Research CentreSanofiAstraZenecaCambridge University HospitalsPfizer
Mots-clésMendelian randomizationExpression quantitative trait lociTMPRSS2Internal medicineGenome-wide association studyMedicineBiologyEndocrinologyBioinformaticsGeneticsDiseaseGenotypeSingle-nucleotide polymorphismGeneGenetic variantsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives To use human genetic variants that proxy angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitor drug effects and cardiovascular risk factors to provide insight into how these exposures affect lung ACE2 and TMPRSS2 gene expression and circulating ACE2 levels. Design Two-sample Mendelian randomization (MR) analysis. Setting Summary-level genetic association data. Participants Participants were predominantly of European ancestry. Variants that proxy ACE inhibitor drug effects and cardiometabolic risk factors (body mass index, chronic obstructive pulmonary disease, lifetime smoking index, low-density lipoprotein cholesterol, systolic blood pressure and type 2 diabetes mellitus) were selected from publicly available genome-wide association study data (sample sizes ranging from 188,577 to 898,130 participants). Genetic association estimates for lung expression of ACE2 and TMPRSS2 were obtained from the Gene-Tissue Expression (GTEx) project (515 participants) and the Lung eQTL Consortium (1,038 participants). Genetic association estimates for circulating plasma ACE2 levels were obtained from the INTERVAL study (4,947 participants). Main outcomes and measures Lung ACE2 and TMPRSS2 expression and plasma ACE2 levels. Results There were no association of genetically proxied ACE inhibition with any of the outcomes considered here. There was evidence of a positive association of genetic liability to type 2 diabetes mellitus with lung ACE2 gene expression in GTEx (p = 4×10 −4 ) and with circulating plasma ACE2 levels in INTERVAL (p = 0.03), but not with lung ACE2 expression in the Lung eQTL Consortium study (p = 0.68). There were no associations between genetically predicted levels of the other cardiometabolic traits with the outcomes. Conclusions This study does not provide evidence to support that ACE inhibitor antihypertensive drugs affect lung ACE2 and TMPRSS2 expression or plasma ACE2 levels. In the current COVID-19 pandemic, our findings do not support a change in ACE inhibitor medication use without clinical justification. Summary boxes What is already known on this topic Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is responsible for the current coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. Serine protease TMPRSS2 is involved in priming the SARS-CoV-2 spike protein for cellular entry through the angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) receptor. Expression of ACE2 and TMPRSS2 in the lung epithelium might have implications for risk of SARS-CoV-2 infection and severity of COVID-19. What this study adds We used human genetic variants that proxy ACE inhibitor drug effects and cardiometabolic risk factors to provide insight into how these exposures affect lung ACE2 and TMPRSS2 expression and circulating ACE2 levels. Our findings do not support the hypothesis that ACE inhibitors have effects on ACE2 expression. We found some support for an association of genetic liability to type 2 diabetes mellitus with higher lung ACE2 expression and plasma ACE2 levels, but evidence was inconsistent across studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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