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Enregistrement W3016306959 · doi:10.1002/hbm.25015

The <scp>ENIGMA</scp> Stroke Recovery Working Group: Big data neuroimaging to study brain–behavior relationships after stroke

2020· review· en· W3016306959 sur OpenAlexafffund
Sook‐Lei Liew, Artemis Zavaliangos‐Petropulu, Neda Jahanshad, Catherine E. Lang, Kathryn S. Hayward, Keith R. Lohse, Julia M. Juliano, Francesca Assogna, Lee A. Baugh, A. K. Bhattacharya, Bavrina Bigjahan, Michael R. Borich, Lara A. Boyd, Amy Brodtmann, Cathrin M. Buetefisch, Winston D. Byblow, Jessica M. Cassidy, Adriana Bastos Conforto, R. Cameron Craddock, Michael A. Dimyan, Adrienne N. Dula, Elsa Ermer, Mark R. Etherton, Kelene A. Fercho, Chris M. Gregory, Shahram Hadidchi, Jess A. Holguin, Darryl Hwang, Simon Jung, Steven A. Kautz, Mohamed Salah Khlif, Nima Khoshab, Bokkyu Kim, Hosung Kim, Amy Kuceyeski, Martín Lotze, Bradley J. MacIntosh, John L. Margetis, Feroze B. Mohamed, Fabrizio Piras, Ander Ramos‐Murguialday, Geneviève Richard, Pamela Roberts, Andrew D. Robertson, Jane Maryam Rondina, Natalia S. Rost, Nerses Sanossian, Nicolas Schweighofer, Na Jin Seo, Mark S. Shiroishi, Surjo R. Soekadar, Gianfranco Spalletta, Cathy M. Stinear, Anisha Suri, Wai Kwong Tang, Gregory Thielman, Daniela Vecchio, Arno Villringer, Nick Ward, Emilio Werden, Lars T. Westlye, Carolee J. Winstein, George F. Wittenberg, Kristin A. Wong, Chunshui Yu, Steven C. Cramer, Paul M. Thompson

Notice bibliographique

RevueHuman Brain Mapping · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Ischemic Stroke Management
Établissements canadiensResearch Institute for AgingUniversity of TorontoOntario Brain InstituteUniversity of WaterlooSunnybrook Health Science CentreUniversity of British ColumbiaVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilNational Institute of General Medical SciencesNational Institute on AgingEinstein Stiftung BerlinNational Key Research and Development Program of ChinaHealth Research Council of New ZealandNational Institute of Neurological Disorders and StrokeHelse Sør-Øst RHFNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthMax-Planck-GesellschaftMinistero della SaluteDeutsche ForschungsgemeinschaftBundesministerium für Bildung und ForschungBrightFocus FoundationEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionEberhard Karls Universität TübingenStroke AssociationU.S. Department of Veterans AffairsCenter for Integrated Healthcare, U.S. Department of Veterans AffairsNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Heart AssociationBrain and Behavior Research FoundationNational Health and Medical Research CouncilNational Institute of Nursing ResearchNational Institute of Mental HealthHorizon 2020 Framework ProgrammeNorges ForskningsrådLeon Levy Foundation
Mots-clésNeuroimagingStroke (engine)NeuroinformaticsData collectionHarmonizationDemographicsBig dataMedicinePsychologyPhysical medicine and rehabilitationData scienceNeuroscienceComputer scienceData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The goal of the Enhancing Neuroimaging Genetics through Meta-Analysis (ENIGMA) Stroke Recovery working group is to understand brain and behavior relationships using well-powered meta- and mega-analytic approaches. ENIGMA Stroke Recovery has data from over 2,100 stroke patients collected across 39 research studies and 10 countries around the world, comprising the largest multisite retrospective stroke data collaboration to date. This article outlines the efforts taken by the ENIGMA Stroke Recovery working group to develop neuroinformatics protocols and methods to manage multisite stroke brain magnetic resonance imaging, behavioral and demographics data. Specifically, the processes for scalable data intake and preprocessing, multisite data harmonization, and large-scale stroke lesion analysis are described, and challenges unique to this type of big data collaboration in stroke research are discussed. Finally, future directions and limitations, as well as recommendations for improved data harmonization through prospective data collection and data management, are provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,028
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,056
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,148

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0280,056
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0060,007
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,205
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,143 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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