Distribution of genes related to Type 6 secretion system and lipooligosaccharide that induced ganglioside mimicry among Campylobacter jejuni isolated from human diarrhea in Thailand
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Campylobacter jejuni(C. jejuni) is one of the most common bacteria responsible for human gastroenteritis worldwide. The mode of human transmission is foodborne infections due to consumption of contaminated food, especially poultry. Type 6 secretion systems (T6SS) were described recently asCampylobactervirulence mechanisms. Furthermore, infection sequelae associated with neurological disorders like Guillain–Barré (GBS) and Miller Fisher (MF) syndromes can become serious health problems in some patients afterCampylobactergastroenteritis. Our objective was to determine the distribution of these virulence genes amongC. jejuniisolated from stool of human diarrhea. Methods A total of 524C. jejunistrains from travelers and pediatric cases of acute diarrhea in Thailand were selected for this study. All isolates belonged to one of 20 known capsule types and all were assayed by PCR for T6SS, a hemolysin co-regulated protein (hcp) gene, and GBS-associated genes (cgtA,cgtB,cstIIHS19andcstIIHS2) which are involved in sialic acid production in the lipooligosaccharide (LOS) cores ofC. jejuni. The distribution of these genes are summarized and discussed. Results Of all isolates with these 20 capsule types identified, 328 (62.6%) were positive forhcp, ranging from 29.2 to 100% among 10 capsule types. The GBS-associated LOS genes were detected among 14 capsule type isolates with 24.4% and 23.3% ofC. jejuniisolates possessed eithercstIIHS19or all three genes (cgtA,cgtBandcstIIHS19), which were classified as LOS classes A and B whereas 9.2% ofC. jejuniisolates possessingcstIIHS2were classified as LOS class C. TheC. jejuniisolates of LOS A, B, and C together accounted for 56.9% of the isolates among 14 different capsule types while 31.1% of allC. jejuniisolates did not possess any GBS-associated genes. No significant difference was detected fromC. jejuniisolates possessing GBS-associated LOS genes among travelers and children, but changes between those withhcpwere significant (p < 0.05). Conclusions Our results suggested a high diversity ofhcpand GBS-associated LOS genes among capsule types ofC. jejuniisolated from Thailand.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».