Structure of the Peptidoglycan Synthase Activator LpoP in Pseudomonas aeruginosa
Notice bibliographique
Résumé
Peptidoglycan (PG) is an essential component of the bacterial cell wall and is assembled from a lipid II precursor by glycosyltransferase and transpeptidase reactions catalyzed in particular by bifunctional class A penicillin-binding proteins (aPBPs). In the major clinical pathogen Pseudomonas aeruginosa, PBP1B is anchored within the cytoplasmic membrane but regulated by a bespoke outer membrane-localized lipoprotein known as LpoP. Here, we report the structure of LpoP, showing an extended N-terminal, flexible tether followed by a well-ordered C-terminal tandem-tetratricopeptide repeat domain. We show that LpoP stimulates both PBP1B transpeptidase and glycosyltransferase activities in vitro and interacts directly via its C terminus globular domain with the central UB2H domain of PBP1B. Contrary to the situation in E. coli, P. aeruginosa CpoB does not regulate PBP1B/LpoP in vitro. We propose a mechanism that helps to underscore similarities and differences in class A PBP activation across Gram-negative bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».