Role for the shelterin protein TRF2 in human herpesvirus 6A/B chromosomal integration
Notice bibliographique
Résumé
Human herpesviruses 6A and 6B (HHV-6A/B) are unique among human herpesviruses in their ability to integrate their genome into host chromosomes.Viral integration occurs at the ends of chromosomes within the host telomeres.The ends of the HHV-6A/B genomes contain telomeric repeats that facilitate the integration process.Here, we report that productive infections are associated with a massive increase in telomeric sequences of viral origin.The majority of the viral telomeric signals can be detected within viral replication compartments (VRC) that contain the viral DNA processivity factor p41 and the viral immediate-early 2 (IE2) protein.Components of the shelterin protein complex present at telomeres, including TRF1 and TRF2 are also recruited to VRC during infection.Biochemical, immunofluorescence coupled with in situ hybridization and chromatin immunoprecipitation demonstrated the binding of TRF2 to the HHV-6A/B telomeric repeats.In addition, approximately 60% of the viral IE2 protein localize at cellular telomeres during infection.Transient knockdown of TRF2 resulted in greatly reduced (13%) localization of IE2 at cellular telomeres (p<0.0001).Lastly, TRF2 knockdown reduced HHV-6A/B integration frequency (p<0.05), while no effect was observed on the infection efficiency.Overall, our study identified that HHV-6A/B IE2 localizes to telomeres during infection and highlight the role of TRF2 in HHV-6A/B infection and chromosomal integration. Author summaryHuman herpesvirus 6A and 6B (HHV-6A/B) are able to integrate their genome into host chromosomes.Viral integration occurs at the ends of chromosomes within the host telomeres, containing hundreds to thousands tandem TTAGGG repeats.The ends of the HHV-6A/B genomes also contain telomeric repeat arrays (15-180 repeats) that play an important role in chromosomal integration; however, their impact on telomere homeostasis remains unknown.In the current study we provide evidence that HHV-6A/B DNA
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».