MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3016648211 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.02054

Immunolocalization of the Novel Protein FCHSD2 within Protrusive Actin‐Rich Bacterial Structures

2020· article· en· W3016648211 sur OpenAlexaff
Brittany Dominique Walker, Le­onardo Almeida-Souza, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyActinEndocytosisBiologyClathrinActin cytoskeletonActin-binding proteinMicrofilamentActin remodelingCytoskeletonCellBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Listeria monocytogenes and enteropathogenic E. coli (EPEC) both exploit clathrin mediated endocytosis and the actin cytoskeleton for their disease processes. During L. monocytogenes infections clathrin is used for the microbes to invade their host’s cells and actin filaments are used to generate actin‐rich comet/rocket tails that propel the bacteria within the host cell cytoplasm. When the bacteria hit the host plasma membrane, the comet/rocket tails push the bacteria into neighbouring cells by forming a membrane distention housing the bacteria and the actin tail which forms a corresponding invagination in the neighbouring cell for eventual cell‐to‐cell spreading of the bacteria. EPEC on the other hand remains extracellular and sit atop infected cells on actin‐rich pedestal‐like structures that also recruit clathrin to their apical regions. The FCH and double SH3 domains protein 2 (FCHSD2) functions to activate actin polymerization during clathrin mediated endocytosis. As both L. monocytogenes an EPEC utilize CME and actin polymerization we examined the localization of FCHSD2 during the infections. We found that during L. monocytogenes infections FCHSD2 was absent from the bacterial comet tails, but was prominent at L. monocytogenes actin‐rich membrane protrusions. During EPEC infections FCHSD2 was present within the actin core of the pedestals but did not colocalize with clathrin. Together, this work suggests the FCHSD2 protein has a distinct role at actin‐rich bacterial structures that interact at the membrane which is independent of clathrin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetListeria monocytogenes in Food Safety→Travaux en français237 207→