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Enregistrement W3016819966 · doi:10.17975/sfj-2020-002

<i>PEX1</i> and <i>PEX7</i> Genes are Necessary for Completion of Immune Pathways and Survival Post-Infection

2020· article· en· W3016819966 sur OpenAlexafffundvenue
Sara A. Murphy

Notice bibliographique

RevueSTEM Fellowship Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesDalhousie University
Mots-clésPeroxisomeImmune systemInnate immune systemBiologyImmunityCell biologyFunction (biology)Drosophila melanogasterBiogenesisOrganismGeneImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The innate immune system consists of a variety of different immune pathways including the c-Fos and NF-κB immune pathways and is the first line of an organism’s defence against infection. This research analyzes the role of peroxisomes, an organelle present in eukaryotic cells, in the regulation of the c-Fos mediated pathway in innate immunity. Quantitative PCR was used to measure how reduced peroxisome function affected the relative expression of c-Fos in human fibroblasts. The effects of impaired peroxisome function on the overall ability of an organism to fight off infection were investigated by tracking Drosophila melanogaster survival post-infection with E. coli. In addition, the effects of peroxisomes on NF-κB regulated pathway were quantified in D. melanogaster fibroblasts by measuring the relative expression of NF-κB. Results showed that at least partial peroxisome function is necessary for the c-Fos and NF-κB mediated pathways and that without peroxisomes, D. melanogaster has a significantly reduced chance of survival post-infection. Interestingly, greater concentrations of fatty acids in the cell were shown to have an inhibitory effect on the cell’s ability to complete the immune response. Overall, this study provides evidence that peroxisomes are necessary for innate immune function. More extensive future research on peroxisome function could be used to applied to better understand and treat immune disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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