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Enregistrement W3017002183 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.04156

Structural and Functional Insights into TAZ2‐mediated CBP/p300 Recruitment by the Melanogenic Transcription Factor MITF

2020· article· en· W3017002183 sur OpenAlexaffabout
Alexandra D. Brown, Kathleen L. Vergunst, Makenzie Branch, George Baillie, Denis J. Dupré, David N. Langelaan

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquemelanin and skin pigmentation
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrophthalmia-associated transcription factorTransactivationTranscription factorIRF4CREBBiologyTranscription (linguistics)Basic helix-loop-helixLeucine zipperCell biologyChromatin immunoprecipitationMolecular biologyChemistryGeneGeneticsPromoterDNA-binding proteinGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microphthalmia‐associated transcription factor (MITF) is a master regulator of development and differentiation within the melanocyte lineage. However, aberrant MITF activity can lead to multiple malignancies such as skin cancer, where it plays a key role in modulating the proliferation and invasiveness of melanoma. MITF is a basic helix‐loop‐helix leucine zipper transcription factor that binds to specific gene promoters via a central DNA‐binding domain. MITF also recruits transcriptional co‐activators, such as the histone acetyltransferase CREB‐binding protein and its homologue p300 (CBP/p300) through an N‐terminal acidic transactivation domain (TAD), however the details of these interactions are not yet fully understood. In order to gain insight into the mechanisms of gene regulation by MITF, we investigated the structure and functional interaction between MITF‐TAD and the transcription adapter putative zinc finger (TAZ2) domain of CBP/p300. In mammalian‐one‐hybrid assays MITF transcriptional activity was enhanced in the presence of co‐transfected CBP/p300 and abolished upon deletion of residues within the MITF‐TAD. Peptide microarrays indicated that no one residue of MITF is essential for TAZ2 binding, however, deletion of multiple residues in MITF‐TAD ablated its ability to bind TAZ2. NMR‐based chemical shift mapping experiments determined that MITF‐TAD interacts with the same surface of TAZ2 as the adenoviral protein E1A, which has been shown to inhibit MITF function. We determined that E1A and MITF‐TAD directly compete for CBP/p300 through the TAZ2 domain using NMR‐based titrations, pulldown, and mammalian‐hybrid assays. Furthermore, we used qPCR to measure the effect of disrupting these interactions on the transcription of MITF‐specific target genes in melanoma‐derived cell lines. Understanding mechanistic details regarding the interaction between MITF and its co‐activators is fundamental to our understanding of gene regulation by MITF and may outline a potential new strategy to inhibit MITF function. Support or Funding Information This research was funded by the Beatrice Hunter Cancer Research Institute, Nova Scotia Heath Research Foundation Scotia Scholars Award, a Canadian Institutes of Health Research studentship, Dalhousie Nova Scotia Graduate Scholarship, and Izaak Walton Killam Predoctoral Scholarship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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