A Mouse Model for Cerebro‐Costo‐Mandibular Syndrome (CCMS) with an Intronic Deletion in <i>SnrpB</i>
Notice bibliographique
Résumé
SNRPB , an essential effector of the spliceosomal complex, is implicated in the splicing of mature mRNA and is mutated in a rare craniofacial disorder known as Cerebro‐costo‐mandibular syndrome (CCMS). Most CCMS patients carry point mutations in the highly conserved alternative exon 2 (AE2) of SNRPB , leading to increased inclusion of a pre‐termination codon (PTC) and reduced levels of the protein‐coding transcript. Given that SNRPB is implicated in all steps of splicing, it was thought that its requirement would be equivalent in all cells and tissues. However, CCMS patients predominantly present with micrognathia and rib defects with variable penetrance. We hypothesize that a subset of transcripts is highly sensitive to the levels of SNRPB during development and is tissue specific. Here, we are generating a mouse model for CCMS to uncover those transcripts that play an essential role in craniofacial development. Using the CRISPR/Cas9 gene‐editing system, we developed a mutant mouse line with a 61 base‐pair (bp) intronic deletion upstream of the AE2. Interestingly, a subset of the heterozygous and homozygous embryos and pups for this deletion show morphological abnormalities in the face, head, ribs, and limbs. Moreover, a significant percentage of the mutants with the 61‐bp deletion die in their first year of life. A subgroup of the heterozygous and homozygous mutant embryos show increased inclusion of the PTC containing AE2 and reduced SNRPB protein levels. We presume that this predominant inclusion of the AE2 induces non‐sense mediated decay resulting in decreased levels of SNRPB. As our data suggest that the 61 bp intronic sequence plays a critical role in regulating SNRPB levels in mice, we are currently investigating if similar intronic sequences in intron 2 of human SNRPB are involved in the preferential splicing of AE2. In addition, we generated a SnrpB conditional knockout mouse model, which will be used in parallel with the deletion model to investigate the cell‐type‐specific roles of SNRPB during craniofacial development. Our novel model for CCMS will further our understanding of the role of SNRPB in craniofacial development. Support or Funding Information Canadian Institutes of Health Research (CIHR)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».