Dynamic expression profiles during development of placodes in the embryonic chicken eye
Notice bibliographique
Résumé
The conjunctival epithelium of the chicken eye develops a series of placodes beginning at embryonic day 6.5. These placodes develop into conjunctival papillae over the course of 1.5 days before disappearing. These transient structures are responsible for inducing the underlying mesenchyme to develop into a ring of scleral ossicles. Here we assess the gene expression patterns of five major signaling pathways known to be involved in the development of other epithelial appendages, namely the WNT/β‐catenin, bone morphogenetic protein (BMP), ectodysplasin (EDA), fibroblast growth factor (FGF) and hedgehog (HH) pathways. Our comprehensive qPCR analyses of distinct regions of the eye, at different time points, enabled us to assess multiple gene expression patterns. Our data show that FGF1, FGF20, sonic hedgehog (SHH), ectodysplasin receptor (EDAR) and BMP4 are amongst the most highly upregulated genes identified in the system. EDAR, FGF20 and SHH were also significantly different across different regions of the eye and over developmental time within specific regions. Correlation analyses among relative normalized gene expression values revealed the strongest correlation between EDA and lymphoid enhancer factor‐1 (LEF1) and between FGF2 and FGF10. The enhanced sensitivity of qPCR reveals a more detailed signaling pattern than previously known. The dynamic expression patterns uncovered here are consistent with a conserved patterning signaling network observed in a diverse range of other placodes, including hair follicles and feather buds. Support or Funding Information This study was funded by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».