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Enregistrement W3017077695 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.08674

Dynamic expression profiles during development of placodes in the embryonic chicken eye

2020· article· en· W3017077695 sur OpenAlexaffabout
Tamara A. Franz‐Odendaal, Jennifer L. Giffin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquedental development and anomalies
Établissements canadiensMount Saint Vincent University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSonic hedgehogBiologyFGF10Fibroblast growth factorWnt signaling pathwayHedgehogMesenchymeMorphogenEndodermCell biologyEnhancerBone morphogenetic protein 4Gene expressionEmbryonic stem cellGeneticsSignal transductionGeneReceptorEmbryo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The conjunctival epithelium of the chicken eye develops a series of placodes beginning at embryonic day 6.5. These placodes develop into conjunctival papillae over the course of 1.5 days before disappearing. These transient structures are responsible for inducing the underlying mesenchyme to develop into a ring of scleral ossicles. Here we assess the gene expression patterns of five major signaling pathways known to be involved in the development of other epithelial appendages, namely the WNT/β‐catenin, bone morphogenetic protein (BMP), ectodysplasin (EDA), fibroblast growth factor (FGF) and hedgehog (HH) pathways. Our comprehensive qPCR analyses of distinct regions of the eye, at different time points, enabled us to assess multiple gene expression patterns. Our data show that FGF1, FGF20, sonic hedgehog (SHH), ectodysplasin receptor (EDAR) and BMP4 are amongst the most highly upregulated genes identified in the system. EDAR, FGF20 and SHH were also significantly different across different regions of the eye and over developmental time within specific regions. Correlation analyses among relative normalized gene expression values revealed the strongest correlation between EDA and lymphoid enhancer factor‐1 (LEF1) and between FGF2 and FGF10. The enhanced sensitivity of qPCR reveals a more detailed signaling pattern than previously known. The dynamic expression patterns uncovered here are consistent with a conserved patterning signaling network observed in a diverse range of other placodes, including hair follicles and feather buds. Support or Funding Information This study was funded by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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