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Enregistrement W3017091245 · doi:10.1096/fasebj.2020.34.s1.02158

Evidence for a novel interaction between key enzymes in the lipid biosynthesis pathway in <i>S. cerevisiae</i>

2020· article· en· W3017091245 sur OpenAlexaffabout
Brianna Greenwood, David A. Stuart

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryBiosynthesisEnzymeYeastBiologyLysophosphatidic acidChemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipids are essential for energy storage and integrity of membranes in organisms ranging from humans to yeast. The biological properties of triglycerides and other lipids are determined by their composition and the order of assembly. Previous research has demonstrated that acyl‐CoA molecules are delivered to the enzymes involved in lipid biosynthesis in a specific order. It has been proposed that this ordered assembly is achieved by means of a membrane‐bound lipid synthesis complex in which the key enzymes interact through specific protein‐protein contacts. Preliminary data from yeast two‐hybrid and coimmunoprecipitation studies have revealed specific protein‐protein interactions between lipid synthesizing enzymes. Interactions were found between Ole1, the main desaturase in yeast, and Dga1, the terminal enzyme in the triglyceride synthesis pathway, as well as between Ole1 and Slc1, a protein that acylates lysophosphatidic acid. Future research aims to determine the other proteins in complex with Ole1 with a biotin ligase proximity assay and direct interactors via in vitro studies. This research is revealing the architecture of the enzyme complex and how it controls lipid synthesis and composition. Investigating the lipid biosynthesis complex will have implications for a wide variety of applied research, from treating lipid dysregulation in humans to biofuel production by microbes. Support or Funding Information NSERC, BioIndustrial Innovates Canada, Alberta Innovates Biofutures, University of Alberta Faculty of Medicine and Dentistry

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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