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Enregistrement W3018197557 · doi:10.1094/pdis-03-20-0602-pdn

First Report of <i>Fusarium equiseti</i> as the Causal Agent of Seed Rot of <i>Matthiola longipetala</i> in Serbia

2020· article· en· W3018197557 sur OpenAlexaboutno aff
Žarko Ivanović, Dragana Milošević, Maja Ignjatov, Ana Marjanović‐Jeromela, Maja Karaman, Mila Grahovac

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistarstvo Prosvete, Nauke i Tehnološkog Razvoja
Mots-clésBiologyBotanyFusarium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Matthiola longipetala (Vent) DC, commonly known as “night-scented stock” or “evening stock”, is the most widely cultivated species of the genus Matthiola in the family Brassicaceae. It is a common garden flower, available in a variety of colors, many of which are heavily scented and also used in floristry. An elevated incidence of Fusarium was observed during a routine quality control seed assay of M. longipetala obtained from a private production facility in Đurđevo (South Bačka District) in 2018. Fungal infection was noticed on an average of 30% of the tested seed, followed by a reduction in germination. The infected seed was covered with white to beige mycelium. Prior to isolation, seeds were surface sterilized for 10 min with a 1% sodium hypochlorite solution to reduce contaminants, washed twice in sterile water, and plated on potato dextrose agar (PDA). After 7 days of incubation at 25°C under a 12-h/12-h photoperiod of fluorescent light, 14 Fusarium (JBL4089/1 to 14) isolates were single spored and subcultured on both PDA and carnation leaf agar (CLA). Pathogenicity was performed in vitro using a modified PDA slant method in a test tube (Porter et al. 2015). A piece of mycelium of each isolate grown on PDA for 7 days was placed at the bottom of each tube, and dried M. longipetala seed was carefully placed 2 cm above the inoculum. After 10 days, fungal mycelia of 14 isolates completely covered the seedlings, causing seed rot and seedling decay. The Fusarium was reisolated on PDA and used for further analysis in order to morphologically identify the species. Isolate JBL4089/2 formed abundant, loosely floccose, whitish aerial mycelium with beige pigmentation. After transfer to CLA, the isolate formed macroconidia with a tapered and elongated apical cell and prominent foot-shaped basal cell, which were typically four to five septate, with average dimensions of 21 to 60 × 2.8 to 4.6 µm. The isolate formed chlamydospores, but microconidia were not observed. Based on the morphological characteristics, isolate JBL4089/2 was identified as Fusarium equiseti (Corda) Sacc. according to Leslie and Summerell (2006) and Gerlach and Nirenberg (1982). Identification of isolate JBL4089/2 was confirmed by amplification and sequencing of a portion of the translation elongation factor-1 alpha (EF-1α) gene. Total DNA was extracted directly from fungal mycelium with a DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germany), and PCR amplification was performed with primer pair EF-1/EF-2 (O’Donnell et al. 1998). Sequence analysis of the EF-1α gene revealed 100% nucleotide identity of isolate JBL4089/2 (GenBank accession no. MK061538) with the EF-1α sequences of two F. equiseti isolates from Canada (KU587617 from Pisum sativum and MH315936 from Glycine max) and a Hyssopus officinalis isolate (MK061540) of F. equiseti from Serbia. To our knowledge, this is the first report of F. equiseti as a causal agent of seed rot on M. longipetala in Serbia. The presence of the pathogen could cause significant economic losses in M. longipetala production, and for that reason control strategies for the management of the disease should be implemented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
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