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Enregistrement W3018324814 · doi:10.1111/1462-2920.15042

Swarming motility growth favours the emergence of a subpopulation of <scp> <i>Pseudomonas aeruginosa</i> </scp> quorum‐sensing mutants

2020· article· en· W3018324814 sur OpenAlexafffund
Sophie Robitaille, Marie‐Christine Groleau, Éric Déziel

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSwarming (honey bee)Swarming motilityBiologyQuorum sensingMutantFlagellumMotilityPseudomonas aeruginosaPhenotypeBiofilmPopulationGeneticsGeneMicrobiologyCell biologyExperimental evolutionBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Pseudomonas aeruginosa exploits several types of motility behaviours to colonize diverse environments. One of these is swarming motility, a coordinated group movement on a semi‐solid surface. This bacterium needs to express a functional flagellum and produce rhamnolipids to display this type of social motility. A Δ hptB mutant, a gene part of the Gac/Rsm signalling pathway, produces rhamnolipids and expresses a functional flagellum but has an important swarming defect. Experimental‐directed evolution was performed on this mutant under swarming conditions to obtain compensatory mutations and thus identify genes responsible for its deficient swarming phenotype. Unexpectedly, a gain‐of‐function subpopulation emerged from this evolution with mutations in lasR , which codes for a key quorum‐sensing transcriptional regulator. Furthermore, we found that lasR − mutants even emerge at high frequencies in the wild‐type strain when using the same experimental evolution strategy. The resulting evolved population, largely composed of LasR‐defective mutants, is fitter than the original strain in swarming motility. We also established that lasR − mutants have a growth advantage under swarming conditions when compared with wild‐type. Our results demonstrate that a social phenotype, that is, swarming motility, favours the emergence of mutants deficient in a quorum‐sensing regulatory pathway to the benefit of the whole population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,654

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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