High specificity and tight spatial restriction of self-biotinylation by DNA and RNA G-Quadruplexes complexed in vitro and in vivo with Heme
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Guanine-rich, single-stranded DNAs and RNAs that fold to G-quadruplexes (GQs) are able to complex tightly with heme and display strongly enhanced peroxidase activity. Phenolic compounds are particularly good substrates for these oxidative DNAzymes and ribozymes; we recently showed that the use of biotin-tyramide as substrate can lead to efficient GQ self-biotinylation. Such biotinylated GQs are amenable to polymerase chain reaction amplification and should be useful for a relatively non-perturbative investigation of GQs as well as GQ-heme complexes within living cells. Here, we report that in mixed solutions of GQ and duplex DNA in vitro, GQ biotinylation is specifically >104-fold that of the duplex, even in highly concentrated DNA gels; that a three-quartet GQ is tagged by up to four biotins, whose attachment occurs more or less uniformly along the GQ but doesn't extend significantly into a duplex appended to the GQ. This self-biotinylation can be modulated or even abolished in the presence of strong GQ ligands that compete with heme. Finally, we report strong evidence for the successful use of this methodology for labeling DNA and RNA within live, freshly dissected Drosophila larval salivary glands.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle